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目的
分析正常-癫痫-伽玛刀治疗过程中起核心调控作用的基因及其涉及的功能和信号转导途径,从基因表达水平探讨伽玛刀治疗癫痫的机制。
方法应用立体定向技术建立大鼠颞叶癫痫模型,进行伽玛刀照射,提取海马RNA进行芯片杂交、清洗、染色和扫描,获取芯片数据。基于芯片数据对正常-癫痫-伽玛刀治疗进行差异基因筛选,分析基因表达趋势,并对差异基因进行功能及信号转导通路分析,构建目标趋势的动态差异基因的共表达调控网络,从网络中得到正常-癫痫-伽玛刀治疗过程中起核心调控作用的基因群体。
结果按照1.5倍法筛选得到正常-癫痫-伽玛刀治疗3组间并集差异基因766个,这些差异基因涉及离子转运(P=6.85×10-24)、细胞黏附(P=1.55×10-8)、机械刺激反应(P=7.86×10-7)、钾离子转导(P=2.63×10-6)等生物功能及MAPK信号通路(P=5.55×10-6)、钙离子信号通路(P=4.29×10-5)、TGF-β信号通路(P<0.01)等信号转导途径,共表达网络分析得到的核心调控基因包括Arf3、Akap5、Omd、Rtn4r等。
结论伽玛刀通过调节具有不同功能、介导不同信号转导途径的靶基因实现其对颞叶癫痫大鼠的治疗作用。