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历年来我国各级政府都设立了各种基金对初创型科技型企业进行扶持,其金额巨大,但基金的效益如何,学术界一直缺乏深入研究。本文首先基于因子分析法对反映企业的盈利与成长的各项绩效指标进行聚类建立综合绩效评价模型;然后运用偏最小二乘法(PLS)对影响政府基金绩效因素进行分析。从而得到如下几个结论:整体上看,政府基金支持对初创企业综合绩效是有影响的,且PLS系数方向来看,企业获利能力和发展潜力越大,基金绩效越好;从系数大小来看,获利能力对基金绩效的影响大于其发展潜力,证明企业拿到政府基金之后用于改善自身的财务状况而疏忽长远发展。结论为政府今后对初创企业制定政策或设立基金提供了一定的理论支撑。