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有效的科研绩效评价对高校的可持续发展有重要的意义。数据包络分析（DEA）方法是一种针对多投入多产出问题的相对效率评价方法。本文运用DEA方法,把某高校的二级学院作为决策单元,科研的人员数量、科研投入作为投入指标,科研成果作为产出指标,对学院的科研绩效进行分析和评价,并对相应的学院提出改进建议。本文为DEA方法广泛运用到高校科研绩效评价上提供了理论依据。