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研究水利工程生态效应的区域响应问题，对于实现区域社会、经济与生态系统等的可持续发展和水资源可持续利用，实现人与自然的和谐相处，具有重要的科学意义和广阔的应用发展前景。通过对水利工程生态效应区域响应内涵的定义，响应发生的机理和层次的阐述，评价体系和模型的建立，以飞来峡水利枢纽工程为例进行了评价。结论是：总体上表现为生态正效应，但生态正效应很一般；如果枢纽工程的运行和管理措施不当，也容易导致区域生态负效应的出现。