高致病性PRRSVTJ株Nsp2蛋白的缺失及其二级结构预测

来源 :湖南农业大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jscumt
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根据GenBank上发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRrSV)TJ株F3代全基囚序列(GenBank登录号为EU860248),结合多个PRRSV亚洲株Nsp2基因比对结果,设计合成引物,选择高敛病性PRRSVTJ株噬斑克隆纯化前后14个不同代次,利用合成的引物扩增各代次Nsp2基因的高变区片段及F3代和F92代Nsp2全基因,并进行产物克隆和氨基酸序列分析及结构预测。测序结果表明:PRRSVTJ株住克隆传代过程中出现了序列整段缺失,共缺失120个氨基酸,并且从F18代噬斑克隆开始一直稳定存在。缺失高变区
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