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鱼类养殖场的残饲、鱼粪等有机物的不断产生，污染了渔场周围的底质及水质环境，招致饲料效率降低，鱼病频发，也是形成赤潮的一个重要原因。如鲕鱼养殖场产生的有机沉降物质可涉及网箱周围50米的范围。在沉降到堆积的过程中，有机物会迅速分解，海水交换好的渔场，初年约有80％被分解，条件差的仅分解50～60％。