目的分析对比2型糖尿病治疗中黄连素益生菌调节肠道菌群联合二甲双胍与胰岛素治疗的效果差异。方法选择2013年1月—2016年1月该院门诊接诊的2型糖尿病患者100例。利用奇偶数字分组法,将100例入选病患随机分成两组:观察组和对照组各自有50例患者。对照组患者应用胰岛素治疗方案,观察组患者应用黄连素益生菌调节肠道菌群联合二甲双胍治疗方案。综合分析两组用药后肠道菌群等指标的变化情况,并对其临床疗效进行比较。结果观察组疗效的总有效率为96.00%(48/50),对照组为72.00%(36/50)。观察组明显比对照组高,组间差异有统计学意义(P<0.05)。观察组治疗后的双歧杆菌、拟杆菌、乳杆菌检出值分别为(8.6±1.1)、(9.5±1.2)、(6.7±0.5)log N/g,均明显比对照组的(7.6±0.1)、(8.5±0.2)、(5.6±0.1)log N/g升高,组间差异有统计学意义(P<0.05)。此外,观察组治疗之后的肠杆菌、肠球菌与酵母菌检出值和对照组比较均显著降低,组间差异有统计学意义(P<0.05)。结论应用黄连素益生菌调节肠道菌群联合二甲双胍治疗2型糖尿病的整体效果优于胰岛素,对有效控制血糖以及调节肠道菌群有重要意义,值得临床实践中应用并加以推广。