家兔BMP7基因的克隆及其生物信息学分析

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在对已知部分编码序列(CDS)进行分析的基础上,采用RT-PCR分步扩增以及RACE方法,对家兔BMP7基因3′和5′末端未知序列进行了克隆与生物信息学分析。测序结果综合分析表明,所获序列共计1654bp,包括家兔BMP7近全长前肽、全长成熟肽CDS及3′非翻译序列(3′UTR),将已有的序列向5′和3′端分别延伸了395bp和628bp。序列对比表明,克隆的家兔BMP7 CDS部分与人、小鼠的对应序列的同源性分别为91.89%和89.32%,预测的氨基酸序列同源性分别为96.51%和96.01%。家兔BMP7 3′UTR长446bp,与人、小鼠对应序列同源性分别为57.38%和45.57%;具有2个转录终止信号位点。推测家兔BMP7成熟蛋白有BMPs特有的7个位置固定的半胱氨酸残基和TGF-β家族指纹。家兔BMP7 3′UTR区转录终止信号的可选择性可能与基因转录后调控有关。
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