高通量测序对原发性胆汁性胆管炎患者个体水平外周血B细胞受体免疫球蛋白重链互补决定区3免疫组库特征的初步研究

来源 :中华肝脏病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wulaixiaosheng
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目的

分析原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者个体水平外周血B细胞受体免疫球蛋白重链互补决定区3(IGH-CDR3)免疫组库特征,了解其免疫系统多样性的特点。

方法

采用扩增子救援多重PCR(arm-PCR)技术特异性扩增一例PBC患者外周血B细胞受体,即膜表面免疫球蛋白重链IGH-CDR3区核苷酸序列,通过第二代高通量测序技术进行测序,结合生物信息学分析其免疫组库特征。

结果

共测得序列数329 219个,总CDR3序列为325 540个,独特CDR3序列为72 774个,D50为7.7;IGH-CDR3区长度主要为45个核苷酸(nt)(9.6%),N区添加的核苷酸数量频率最高的为13~14 nt(5.25%),J基因片段末端去除的核苷酸数主要是0(12.7%);V基因使用频率最高的前3个等位基因是V4-59(9.5%),其次为V3-23(8.1%)和V1-69(6.4%)。

结论

该PBC患者IGH-CDR3免疫组库多样性程度较低,存在个别克隆异常增殖情况,该特异性有待扩大样本量进一步验证。

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