微泡菌ALW1几丁质酶Chi18A的克隆及信息学分析

来源 :集美大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：TomasZhang_888

【摘要】

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以微泡菌(Microbulbifersp.)ALW1的基因组为模板,利用几丁质酶基因的特异性引物进行PCR扩增,然后将产物插入到pMD18-T载体后进行DNA序列测定,并对目的基因编码的蛋白质序列进

【作者】

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李鹤宾梁梅芳陈仲巍姜泽东倪辉朱艳冰

【机构】

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厦门医学院药学系,集美大学食品与生物工程学院

【出处】

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集美大学学报:自然科学版

【发表日期】

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2019年3期

【关键词】

：

微泡菌几丁质酶克隆信息学分析 Microbulbifer sp. chitinase cloning bioinformatics analysis

【基金项目】

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福建省自然科学基金项目(2016J01162).

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以微泡菌(Microbulbifersp.)ALW1的基因组为模板,利用几丁质酶基因的特异性引物进行PCR扩增,然后将产物插入到pMD18-T载体后进行DNA序列测定,并对目的基因编码的蛋白质序列进行信息学分析。结果显示,克隆的目的基因大小为1644bp,预测编码含有547个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白质序列与其他菌株来源的几丁质酶序列具有70%左右的相似性,表明预测目的基因编码几丁质酶。该蛋白质具有2个几丁质结合结构域和1个GH18家族酶的催化结构域,属于糖苷水解酶(glycoside hydrolase

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