西瓜嗜酸菌pilL菌毛基因的序列分析

来源 :北方园艺 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hyslst

【摘要】

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在西瓜嗜酸菌标准菌株AAC00-1全基因组序列中选取了1个菌毛基因pilL序列,利用这个基因设计引物,选取国内外比较有代表性的7株西瓜嗜酸菌菌株进行PCR扩增,并对PCR产物进行了测

【作者】

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林振亚高必达赵廷昌

【机构】

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湖南农业大学生物安全科学技术学院,中国农业科学院植物保护研究所

【出处】

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北方园艺

【发表日期】

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2013年13期

【关键词】

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西瓜嗜酸菌 pilL基因生物信息学分析 Acidovorax citrulli pilL gene bioinformatics analysis

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在西瓜嗜酸菌标准菌株AAC00-1全基因组序列中选取了1个菌毛基因pilL序列,利用这个基因设计引物,选取国内外比较有代表性的7株西瓜嗜酸菌菌株进行PCR扩增,并对PCR产物进行了测序,从生物信息学的角度对这7个菌株pilL基因的序列特征、同源性、分子聚类、信号肽、疏水性、跨膜结构和二级蛋白结构进行了预测分析。结果表明：Aac5、pslbtw37、W1和pslbtw22 pilL基因之间的核苷酸氨基酸特征相近,同源性高,AAC00-1、AAC203-50和Fc376之间亦如此。预测发现7个编码蛋白表现为亲

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