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蛋白质结构从头预测作为结构生物学领域最为重要和最具挑战性的问题之一,是蛋白质分子从无规则结构逐步折叠成天然态构象的过程。......
蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题，其中一项重要的研究内容是蛋白质分子对接。由于实验测定蛋白质对......
蛋白质与小分子对接技术是基于结构的药物设计的重要技术。早期的分子对接技术将蛋白质当作刚体，与小分子基于形状互补对接。然而很......
计算机分子模拟研究可以从原子水平的分子模型来模拟分子的结构、行为,进而预测体系的各种物理、化学性质,因而可以对物质材料给出......
为了洞察自组装二十烷二羰基二-L-谷氨酸(Eicosanedioyl-di-L-glutamic acid)EDGA球形螺旋纳米管微观结构,我们在大型计算机工作站......
本文在构造具有方向导向性的完全二叉树的基础上,提出了一种适合研究蛋白质构象的格子模型快速穷举搜索算法.该算法通过使用序列分......
为提高分子对接的速度和精度,设计并实现了一种基于改进多亲遗传算法的分子对接构象搜索策略.应用该方法对布克海文蛋白质数据库中......
目的水飞蓟宾RRRR对映体分子中存在多个可变的二面角,可以产生许多立体构象,旨在从理论上寻找其合理构象.方法采用二面角系统搜索......
蛋白质结构预测在生物信息学研究中占有重要地位.此文对遗传算法(GAs)在蛋白质结构预测中的应用作了评述.首先，简要地介绍了遗传算......
研究生物大分子动态行为、有机小分子构象以及两者之间的相互识别、相互作用是基于机理的药物发现的重要方向。有机分子和/或生物......
RosettaLigand使用多次启动对接协议的方式对蛋白质-配体复合物构象空间进行采样,在串行或并行的构象搜索实例之间并不共享采样信......
以极性带正电荷的赖氨酸分子为模型分子,应用ABEEMσπ/MM探究其二肽、三肽的稳定构象,并以从头算方法得到的结果作为标准,进行对......
学位
21世纪新药研究的热点集中于先导化合物的发掘与设计,其中使用计算机辅助药物设计是先导化合物设计的重要方法之一。由于在先导物......
蛋白质结构从头预测是不依赖模板仅从氨基酸序列信息得到天然结构。它的关键是正确定义能量函数、精确选用计算机搜索算法来寻找能......
在药物靶标确定和三维结构已知的情况下,基于受体结构的虚拟数据库筛选方法利用分子对接技术自动地匹配受体结合腔穴和化合物数据......
利用分子的三维特征，在三维结构数据库中进行三维结构搜索的方法是一种发现先导化合物的快捷而有效的方法，已经得到了广泛的重视。本......
分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基......
