来源于广东的一株香蕉线条病毒分离物的全基因组序列分析

来源 :中国植物病理学会2014年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zjh73
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  香蕉是世界四大水果之一,其在世界水果生产中有着极其重要的经济地位.我国是香蕉生产第三大国,广泛种植于广东、海南、云南和广西等各省,是我国热区农业重要的一个支柱产业.由香蕉线条病毒(banana streak virus,BSV)引起的香蕉线条病毒病是我国香蕉生产上一种重要的病毒病害,严重影响和威胁我国香蕉生产的可持续发展.先前我们曾克隆和序列分析了一株广东BSV分离物(BSV-GD)全基因组序列,近期我们在全国香蕉BSV调查中,发现在我国BSV存在较大的遗传多样性.我们进一步选择来源于广东的一个优势分离物(BSV-DN)进行了基因组全序列测定.测定结果表明,BSV-DN全基因组长度为7 768 bp,编码3个阅读框,具有典型的BSV分子结构和特征,与先前我们报道的BSV-GD全基因组序列存在较大的差异,其二者的核苷酸序列相似率只有58.8%.按照BSV种类的分类标准,BSV-DN明显与BSV-GD属于不同的BSV种类.进一步将BSV-DN与已报道的8个BSV种类相比较,其核苷酸序列相似率为44.3%~99.2%,其中与我国已报道和鉴定的云南BSAcYNV的相似率仅为70.4%;与南非BSIMV的相似率最高为99.2%.按照核苷酸序列相似性的分类标准,可将BSV-DN划分为BSIMV种类的一个株系.这表明在我国可能存在较多的BSV种类,进一步的种类鉴定工作正在进行中.
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