【摘 要】
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美洲大蠊(Periplaneta americana)为蜚蠊目蜚蠊科大蠊属物种,是传统的中药,对组织修复有着很好的疗效.本研究对美洲大蠊3-4龄若虫、7-8龄若虫、刚羽化成虫、雌成虫和雄成
【机 构】
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四川大学生命科学学院,四川成都610065
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美洲大蠊(Periplaneta americana)为蜚蠊目蜚蠊科大蠊属物种,是传统的中药,对组织修复有着很好的疗效.本研究对美洲大蠊3-4龄若虫、7-8龄若虫、刚羽化成虫、雌成虫和雄成虫采用Illumina Hiseq2000平台进行转录组双末端测序,用Trinity组装5组样品的共同参考转录本,得到291,250个转录本序列,其中250条转录本序列为美洲大蠊内共生菌Blattabacterium sp.BPLAN所有,转录本序列的N50为1,233bp,长度在200-300 bp的～11万条.通过与各大蛋白质序列数据库比对,一共注释了53,262条转录本,其中NR库注释了52,625条转录本；GO数据库注释了10,122条,注释的GO term中,细胞(cell)、细胞组件(cell part)、绑定(binding)、催化剂(catalytic)、细胞过程(cellular process)和代谢过程(metabolic process)等方面存在较多的转录本；KOG数据库注释了35,595条,其中信号传导机制(signal transduction mechanisms),翻译后修饰,蛋白质翻转(posttranslational modification,protein turnover, chaperones)和转录(transcription)相关的功能的转录本数目较多；swissprot数据库注释33,168条；KEGG数据库注释了18,880条,其中信号传导通路中的转录本数目最多,其次是传染性疾病(infectious diseases)和癌症(cancers).
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