低盐环境下，凡纳滨对虾的营养供应一直是水产养殖业同行关注的问题。饲料中不同脂肪源的添加和配伍是否可以有效提高凡纳滨对虾在低盐环境中的生长状态，除了存活率与增重率，做为宿主最大的营养"器官"之一的肠道微生物是否会受到不同脂肪源的影响是本研究关注的主要科学问题。本实验以六种脂肪源的饲料投喂南美白对虾，这六种脂肪源分别为豆油、鱼油、牛油、亚麻籽油、豆油+牛油+鱼油混合及豆油+牛油+亚麻籽油混合，养殖周期为8周。以存活率和增重率作为凡纳滨对虾生长状态的指标，结果表明豆油+牛油+亚麻籽油混合组与其它组相比，具有较高的存活率与增重率。以高通量测序技术检测不同处理组虾肠道微生物的组成，结果表明虽然不同的脂肪源会对凡纳滨对虾肠道微生物的组成产生一定影响，但变形菌门和无壁菌门仍为凡纳滨对虾肠道中的主要类群。豆油+牛油+亚麻籽油混合组的虾肠道微生物具有更为丰富的微生物多样性，而且在该处理组中根瘤菌科的细菌相较于单独饲喂豆油或牛油的处理组更为优势。同时，我们还检测了水环境中的微生物组成，结果发现水体中的优势细菌是变形菌门，这也表明水生动物肠道微生物的组成也受到其生活环境的影响。综上，本研究提示豆油+牛油+亚麻籽油是低盐度养殖条件下凡纳滨对虾较优的脂肪源组合。同时本研究揭示了水体、饲料原料与宿主肠道微生物组成之间的关系，说明肠道健康与肠道微生物组成的平衡也是评价水生动物健康状况的主要指标之一。