除草剂大量使用在消除杂草危害、提高劳动生产率的同时,也危害生态环境和人类健康,并对作物产生了严重的药害.目前世界上除草剂有600个品种,常用的有近200种.据统计,我国每年除草剂药害面积达3000万亩,其中严重受害500万亩以上,造成巨大的农业损失.相比较杀虫剂,除草剂的环境行为研究特别是微生物降解方面的研究还很少.由于长期种植抗草甘膦转基因作物及使用草甘膦已经导致抗草甘膦杂草出现，因此发掘能够降解其它除草剂的菌株和基因资源具有重要的应用价值。从生产除草剂的工厂污泥及除草剂污染土壤中富集分离到能降解磺酰脲类除草剂、氯代乙酰胺类除草剂、酰胺类除草剂、麦草畏、杀草丹和氟乐灵等除草剂的细菌菌株。二苯醚类化合物是很多除草剂和菊酯类农药的合成中间体，也是这些农药的降解代谢产物。代谢产物分析表明菌株Sphingomonas sp. DC-6降解乙草胺的代谢途径为：乙草胺脱烷基转化为2-氯-N-(2-甲基-6-乙基苯基)乙酰胺（CMEPA），然后酰胺断裂生成2-甲基-6-乙基-苯胺（MEA）。利用鸟枪法从Paracoccus sp. FLN-7基因组中克隆到酰胺酶基因ampA， AmpA能降解乐果、氧化乐果、氯苯胺灵、苯胺灵、氟虫脲、除虫脲、氟铃脲和敌稗等多种酰胺类农药。从细菌Hansschlegelia zhihuaiae S113基因组克隆到一个酯酶基因sulE。SulE降解谱广，可将噻吩磺隆、甲磺隆、氯嘧磺隆、苄嘧磺隆、胺苯磺隆等磺酰脲除草剂的酯键水解，生成相应的无除草活性酸产物。