DNA序列模式的构建及应用

来源 :中国食品科学技术学会第十届年会暨第七届中美食品业高层论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dongfa
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  DNA序列差异在生物之间是一种常态,即使是同一种属的也不例外.本文建立了一种生物类群特定DNA序列的简便表示方法即DNA序列模式.DNA序列模式是指对于特定的DNA序列,将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式,这种合并可以在种、属或其它分类单位水平上进行的,也可以是针对特定的生物类群来进行的.以红曲黄酒酿造体系特有的微生物——红曲霉菌群为研究对象,利用构建方法得到其18S rDNA近全长序列模式,并对其基本序列特性进行分析.结果发现各红曲霉种的18S rDNA序列差异很小,可变位点约占全长的1.35%,然而却集中于两个高可变区中,因此可以作为红曲霉菌群研究的靶标区域.本文构建的DNA序列模式可以直观地展现出研究体系中生物种属或类群的序列特征,从而有利于生物群体特性的分析和研究.
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