尿液样本淋球菌NG-MAST分型研究

来源 :第二届全国皮肤病与性病学博士生学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ljh6090008
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  目的 利用二次PCR 扩增对临床采集的尿液样本进行NG-MAST 分型研究,评价此方法的分型效率并了解不同地区NG-MAST 的型别分布.方法 本研究对88份淋球菌核酸检测阳性的男性性病门诊就诊者(male STDs patients,MSP)的尿液样本用Qiagen 试剂盒提取DNA,并进行二次PCR 扩增porB、tbpB 基因片段,扩增成功的样本测序后登陆NG-MAST 网站进行序列比对,获取菌株基因型别信息.结果 对88 份阳性样本提取DNA 进行单次PCR 扩增porB、tbpB 基因的效率分别为13.6%和14.8%,共有12 份样本比对成功得到菌株基因型别,分型效率为13.6%(12/88);进行二次PCR 扩增后porB、tbpB 基因的PCR 扩增效率分别为71.6%和72.7%,分别增长了58.0%和57.9%,共有62份样本比对成功得到菌株基因型别,分型效率为70.5%(62/88),分型效率提高了56.9%;62 份样本一共分出45 个基因型别,其中40 个型别为已知型别,5 个为新型别.结论 尿液样本可以用于NG-MAST 分型研究,二次PCR 扩增可以提高尿液样本的分型效率,中国不同地区淋球菌NG-MAST 型别多样性较为丰富.
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