用形态指数法和45个经过筛选的灿粳分化特异探针对培矮64S、N422S、108S、LS2S等4个不育系和53份恢复系及其杂种F<,1>进行了灿粳分类。结果表明，亲本中除N422S和108S外，形态指数法分类结果与DNA分类结果是一致的，但DNA的分类结果明显提高了检测不同品种灿粳分化程度的灵敏度。对F<,1>的分类结果表明，用偏灿型的培矮64S为母本，即使与粳稻配组，F<,1>中粳稻类型较少；N422S和108S尽管在形态上偏粳，但其DNA上偏灿，它们与灿稻配组F<,1>为偏灿型，与粳稻配组，F<,1>为粳型或偏粳型。如果以双亲DNA的TDj值的平均值作为F<,1>的TDj值，并以F<,1>的TDj值对F<,1>进行灿粳分类，发现约有78℅的组合的DNA分类结果与形态指数法分类结果一致。