Pdlim1/2/7表达在急性髓系白血病中的临床意义

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目的:近年来,Pdliml/2/7基因已经被报道在实体肿瘤的发生、发展中起着重要作用,是一种癌基因。然而其在恶性血液系统疾病尤其是急性髓系白血病(acute myeloidleukemia,AML)中的作用还有待研究。本研究拟探索AML中Pdliml/2/7基因的表达、甲基化水平及其对患者预后的影响,以期为AML患者的预后分层、疗效观察及病情监控提供有效生物标志。方法:收集AML患者和健康对照骨髓标本,进行RNA、DNA提取,并将RNA逆转录成cDNA、DNA进行亚硫酸氢盐修饰。应用实时定量荧光PCR(real-time quantitative PCR,RQ-PCR)检测 AML 患者中 Pdlim1/2/7 基因表达,并利用 SPSS 20.0软件对数据进行处理。通过应用蛋白印迹法(Westernblot)检测白血病细胞株中Pdlim1蛋白表达。应用实时定量甲基化特异性PCR(real-time quantitative methylation-specific PCR,RQ-MSP)分析 AML 患者中 Pdlim1 启动子区甲基化水平。结果:1.在GEO数据集GSE24006和GSE63270中,Pdlim1基因在AML患者中较对照组表达显著上调(P<0.001)。同时,PCR、Western blot检测Pdlim1 RNA和蛋白在白血病细胞株中表达较高。在全部核型AML患者中,Pdlim1高表达组的男性病人所占比例显著低于Pdlim1低表达组(P=0.019),Pdlim1高表达组中血小板计数(bloodplatelet,PLT)略高于低表达组(P=0.076)。化疗后随访AML患者发现,在正常核型AML(CN-AML)患者中,Pdlim1高表达组患者的完全缓解(completeremission,CR)率较低表达组患者显著减低(P=0.022)。生存分析显示,在84例全部核型AML患者中,Pdlim1高表达患者与低表达患者在总体生存(overall survival,OS)时间差异并不明显(P>0.05)。在 non-APL-AML患者中,Pdliml高表达患者较Pdlim1低表达患者OS时间短,差异趋近于具有统计学意义(P=0.051)。而在 38 例正常核型 AML(cytogenetically normalAML,CN-AML)患者中,Pdlim l高表达患者较低表达患者的O S时间显著缩短(P=0.02)。多因素分析进一步表明,Pdlim1高表达是影响CN-AML患者OS的独立预后不良因素(P=0.018)。TCGA和GSE12417数据集分析同样证实在CN-AML中,Pdlim1高表达组的OS时间较低表达组显著减短(P=0.04,P=0.0037)。2.在GSE63270数据集中,AML患者中Pdlim2的表达明显高于对照组(P<0.001)。本组数据中Pdlim2高表达组的男性病人占比明显高于低表达组(P=0.044),与Pdlim1分析结果相反。Pdlim2高表达组PLT略高于Pdlim2低表达组(P=0.064)。化疗后随访AML患者发现,Pdlim2高表达组CR率明显低于低表达组患者(P=0.005)。通过生存分析发现在全部核型AML中,Pdlim2高表达组患者较Pdlim2低表达组患者的OS时间显著缩短(P=0.018),然而在non-APL-AML与CN-AML中,Pdlim2高低表达组的OS时间差异均无统计学意义(P=0.096,P=0.180)。Cox回归分析证实Pdlim2高表达是影响AML患者OS的独立预后不良因素(P=0.019)。TCGA、GSE6891芯片数据分析结果证实在全部AML患者中Pdlim2高表达组较Pdlim2低表达组的OS时间显著缩短(P<0.001,P<0.001)。3.在GSE24006数据集中,AML患者中Pdlim7表达也较对照组显著上调(P=0.002)。本组数据中Pdlim7高表达组患者的WBC计数较Pdlim7低表达组明显增高(P=0.05),且高表达组患者年龄显著高于低表达组(P=0.002)。Pdlim7高表达组患者的BM原始细胞比例略高于低表达组(P=0.066)。FLT3-ITD突变在Pdlim7高表达组中略高于低表达组(P=0.072)。生存分析表明,在全部核型AML患者中,Pdlim7高表达组患者较Pdlim7低表达组患者的OS时间显著缩短(P=0.037)。在 non-APLAML、CN-AML 中,Pdlim7 高表达患者较 Pdlim7 低表达患者的OS时间略短,但差异均不明显(P=0.132,P=0.094)。TCGA、GSE6981芯片数据分析结果证实在全部核型AML患者中,Pdlim7高表达组较Pdlim7低表达组的OS时间显著缩短(P=0.043,P=0.044)。然而,单多因素分析表明Pdlim7高表达在AML患者中不是影响OS的独立危险因素(P=0.301)。4.AML患者Pdlim1甲基化水平显著高于对照组(P=0.035),然而在Pdliml高、低甲基化组中各临床参数并无明显差别(P>0.05)。进一步分析发现在全部核型AML、non-APL-AML、CN-AML患者中,Pdlim1甲基化水平均对AML患者的OS时间无影响(P>0.05)。通过Pearson相关分析发现Pdlim1甲基化与Pdlim1 表达呈正相关(R=0.464,P<0.0001)。结论:1.Pdlim1/2/7基因高表达是急性髓系白血病中的常见分子事件。2.Pdlim1基因高表达是CN-AML患者的独立不良预后因素。3.Pdlim2基因高表达的AML患者可能预后不良。4.Pdlim1在部分AML中甲基化水平升高,但Pdlim1高甲基化不影响患者预后。
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