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研究背景: 肿瘤组织细胞的微环境在肿瘤的发生发展中发挥着重要的作用。其中肿瘤组织细胞慢性炎症微环境参与肿瘤的发生发展已被大量的实验证据所证明。肿瘤组织细胞炎症微环境的特点是白细胞不仅存在于肿瘤组织外围基质中,还深入浸润到肿瘤组织内部。这些浸润到肿瘤组织内部的白细胞,不仅可以促进肿瘤细胞的生长播散,还可以导致肿瘤免疫抑制。大量的实验证据表明,肿瘤细胞通过表达一些免疫相关基因/蛋白,例如某些细胞因子及其受体等,来模仿免疫细胞的功能。这种免疫特性的获得使得肿瘤细胞不仅可以产生促进其自身生长的蛋白分子等,还可以通过操纵免疫系统产生免疫抑制微环境,促进肿瘤的恶性发展。然而迄今为止,在食管癌组织细胞中,免疫相关基因或蛋白表达及其临床意义尚不甚清楚。 实验研究方法: 首先,我们从18对食管癌及其配对的相对正常食管上皮组织样本的RNA-seq分析中,筛选获得11986个上调表达基因(上调2倍),作为基因集1;其次,从1对永生化食管上皮细胞及其恶性转化的食管癌细胞(SHEE和SHEEC)的RNA-seq分析中,筛选获得2803个上调表达基因,作为基因集2;最后,我们又从KEGG通路中,确定800个发挥免疫功能的基因,作为基因集3。基于此,我们将上述3个基因集进行交叉对比,从中找出34个共有基因。然后,再从该34个共有基因中挑选11基因,其编码蛋白定位于细胞膜,作为本文的候选基因。在此基础之上,我们进一步通过联合应用组织芯片与免疫组化实验方法,选取两个不同的队列,检测上述11个候选基因编码蛋白在食管癌组织中的表达情况,建立食管癌预后预警分子标志物模型,评判食管癌患者预后。 实验结果与结论: 1)经过多个层次的筛选比对分析,本文最终确定的11个候选基因是CCR1、CD40、CD44、CSF2RA、CXCR、F2R、IL3RA、ITGB、LILRB、MME和TLR2;2)免疫组化检测结果表明,上述11个候选基因的编码蛋白在相对正常食管上皮组织、不典型增生食管上皮组织,以及食管癌组织中均有所表达;3)三种组织间比较,总体而言,11个候选基因的编码蛋白在食管癌组织中表达明显增强;4)进一步的食管癌患者生存期相关分析结果表明,CD40、CXCR4、F2R和IL3RA,四者的表达水平,一对一分析,均与食管癌患者的生存期缩短显著相关;5)将CD40、CXCR4、F2R和IL3RA四者,进行四中取三,或全部的组合,构建一联合分子标志物模型,开展食管癌患者生存期预警分析,结果表明,将CD40、CXCR4和F2R三者组合在一起所构筑的联合分子标志物模型,不但拥有食管癌患者总生存生存期与无瘤生存期预警效能,同时还是独立的预后预警因素。