我国保税区是参照国际上自由贸易区的成功经验和通行做法,并结合我国国情而建立和发展起来的特殊经济区域。保税区在促进我国经济发展、扩大对外贸易、连接国内国外两个市场等方面发挥了重要作用。但由于我国加入世界贸易组织以来国内外经济形势的变化对保税区构成了挑战,以及由于保税区自身存在着弊端和问题,导致了保税区的进一步发展受到制约,破解保税区发展的难题在于实现其向世界上通行的自由贸易区转型。本文对我国保税区与世界自由贸易区进行了对比分析,对保税区发展中存在的问题进行了剖析,对转型的经济发展目标模式和管理体制目标模式进行了分析研究。经过对天津港保税区向自由贸易区转型进行必要性和可行性分析,得出了天津港保税区具备向自由贸易区转型条件的结论,区域的功能定位是发展以国际物流和国际贸易为主、临港加工和现代服务为辅的综合功能。管理体制应设置成三层级政府主导型管理机构,更顺畅地实现对转型后的自由贸易区的管理,促进自由贸易区的运作。本文对保税区转型中政府的定位进行了分析阐述,提出了政府在保税区转型中发挥管理与服务功能的对策建议,政府要为保税区转型提供外部条件,推动保税区立法和进行管理体制的设定,解决保税区多头管理的体制问题。中央政府层面建立对全国保税区统一管理的政府机构,履行宏观管理职能；地方政府要建立统一效能的保税区管理机构,建设服务型政府,推进服务体系建设,促进保税区的转型和发展。