针对当前科研项目评价中，特别是不确定因素较多的科研项目的前评价中遇到的困难，本文研究了价值中心思维的基本理论，提出并论证了运用价值中心思维方法进行科研项目评价的解决方案。首先，本文概括论述了科研项目评价的特点、原则、有代表性的评价方法和研究现状。其次，从解决科研项目评价中存在的实际问题出发，本文重点研究了运用价值中心思维进行科研项目评价的一般规律。本文引入了价值中心思维，即一种围绕价值目标和价值模型进行决策评价的方法；设计了以价值中心思维为核心的科研项目评价过程，并通过战略决策评价分析和预研项目方案评价两个科研项目前评价案例，进一步探讨并证实了在科研项目评价中运用价值中心思维方法的可行性，进而初步形成了运用价值中心思维综合集成多种评价方法的科研项目评价理论框架。本文进而对在科研项目评价中运用价值中心思维和选择中心思维评价方法的过程和效果进行了案例对比分析，进一步论证了价值中心思维方法在解决不确定因素较多的复杂科研项目的前评价上具有一定的优势。通过研究发现，作为一种思维方式，价值中心思维可以为解决科研项目评价问题提供一种新的思考模式；价值中心思维作为一种评价方法，不但可以准确地评价，还能够通过评价过程完善科研项目方案，可以在科研项目评价中被很好地应用。