基于肠易激综合征相关靶点的痛泻要方活性成分的虚拟筛选研究

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qishi008
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目的:运用计算机虚拟筛选技术从痛泻要方所含化合物成分中寻找对肠易激综合征具有治疗潜力的化合物分子,为阐明痛泻要方的药效作用机制奠定基础。方法:利用台湾中医药资料库(TCM database@Taiwan)构建痛泻要方化合物成分数据库,共含239种候选化合物,以色氨酸羟化酶1(TPH1),5-羟色胺跨膜转运蛋白(SERT),促肾上腺皮质激素释放因子受体1(CRFR1)和瞬时受体电位香草酸受体1(TRPV1)四个受体靶点作为肠易激综合征相关治疗靶点的研究对象,使用分子对接打分程序AutoDock Vina研究构建的痛泻要方化合物库中的化合物分子与各靶点蛋白之间的结合能力进行评价。对各受体打分结果中的最优配体采用Discovery Studio和MOE软件分析其结合模式和作用关系;利用Discovery Studio软件对各受体打分前五名的配体构建药效团模型,总结它们结构上的共性;利用Cytoscape软件对打分结果进行网络化分析对打分结果进行数据挖掘。结果:将239个配体化合物的打分结果其按自由能由低到高排序,筛选出对四个受体蛋白分子有结合潜力的33个天然化合物,约占整个痛泻要方活性成分配体库的13.8%。通过分析相应受体的配体化合物药效团模型发现,TPH1的配体化合物药效团模型中包含了 2个氢键受体和3个氢键给体;SERT的配体药效团模型主要囊括了 4个氢键受体、2个氢键给体和1个疏水中心;CRFR1的配体药效团模型包含1个氢键受体、2个氢键给体和1个疏水中心;而TRPV1的配体药效团模型则包含3个氢键受体和1个疏水中心,并确定了这些药效团模型的几何约束。配体库中81个化合物具有能够与两个或以上受体蛋白结合的潜力:58个化合物具有与三个或以上受体蛋白结合的潜力;33个化合物具有对四个受体蛋白结合的潜力。结论:痛泻要方中存在与TPH1、SERT、CRFR1、TRPV1四个受体蛋白具有良好结合潜力的化合物。本研究结果为痛泻要方的有效成分筛选提供了预测和参考,同时为从痛泻要方多靶点作用提供了依据。
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