基于生信学方法分析CCR2在肺腺癌患者中的表达

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuyangyy12345
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目的为了探讨CCR2蛋白的表达水平与肺腺癌(LUAD)的临床病理特征之间的关系。方法肿瘤微环境中免疫细胞的组成和相对丰度是影响肺腺癌进展和免疫治疗疗效的关键因素。为评估肿瘤纯度,通过下载肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中的肿瘤基因表达RNA数据集,然后利用CIBERSORT和ESTMATE软件包对基质细胞和免疫细胞进行了评分。对存在高低表达差异的363个基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过差异表达基因的蛋白质相互作用(PPI)和单因素COX回归分析。为验证CCR2在肺腺癌患者组织标本中的表达情况,用免疫组织化学方法检测39例肺腺癌患者肺腺癌组织及10例癌旁对照组织中CCR2蛋白的表达水平。结果确定2个关键的肿瘤微环境(TME)相关基因(CCR2和P2RY13),且在不同年龄、性别和TNM分期的肺腺癌患者中,2个差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)的表达水平存在差异。验证实验发现CCR2在肺腺癌组织与癌旁组织存在显著性差异,但在TNM分期、淋巴结转移、远处转移中未见明显差异。结论CCR2和P2RY13均是表达水平越高,患者预后越好,且通过对CCR2在肺腺癌进行免疫组化分析也提示癌旁组织中CCR2表达较癌组织高。
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