本研究应用微卫星标记技术分析了四个驴品种(甘肃庆阳驴、山东德州驴、山西晋南驴、山西广灵驴)共89 头份试验材料,通过DNA 提取、PCR 扩增、凝胶电泳检测等一系列分子操作技术,分析了6 个微卫星位点(HMS3、HMS6、HMS7、HTG4、HTG15、VHL20)的群体遗传变异,包括多态信息含量(PIC)、等位基因频率(AF)、群体杂合度(H)、有效等位基因数(EA)等。结果显示:6 个微卫星位点在四个驴品种中均有不同程度的遗传变异;各位点的平均PIC、EA和H的范围依次为0.4316～0.6262、2.0207～3.2594、0.4985～0.6847;各位点的等位基因在不同品种间分布不均匀;各品种中占优势的等位基因存在差异。微卫星位点HTG4 的163bp 等位基因在庆阳驴、晋南驴、广灵驴都有较高的频率,德州驴该等位基因频率仅为0.04762,而广灵驴竟达到1,这是很少见的,是何种因素所致,尚待进一步探讨。利用6 个微卫星位点所提供的多态信息,计算四个驴品种相互间的遗传距离,并以此绘制出系统聚类图,可准确地反映四个品种的亲缘关系及其所在地域分布上的差异,可望为保种、开发、利用提供依据。