随着我国经济体制和教育体制的改革，高校办学规模不断扩大，办学层次不断提高，办学形式不断创新，我国高等教育事业得到了长足的发展。这离不开财政的有力支持。特别是自1999年全国普通高校全面扩招以来，高校对资金的需求呈现井喷式上涨。目前高等教育经费存在着数额巨大、来源广泛的特点，这决定了其管理的必要性与复杂性。因此，有必要对高等教育经费进行有效监管，以保证经费的合理使用。但是，高等教育经费运行过程中却存在着诸多问题。一方面，高等教育经费在支出和使用环节的问题层出不穷。很多高校存在着盲目扩张、机构臃肿、浪费严重等问题。另一方面，教育系统本应处于“圣坛”之上，但教育系统内部经济腐败易发、高发的态势令人担忧。因此，必须对高等教育经费加强监管，引导高等教育经费合规、合理使用。《国家中长期教育改革和发展规划纲要（2010-2020）》中明确指出加强经费管理的重要性，并为经费监管指引了方向，但是现存的高等教育经费监管机制却不甚完善。从外部监管而言，上级部门对高校经费使用情况的监管多以突击检查为主，未形成长效机制；从内部监管而言，高校内部缺乏强有力的内部监控机制；从社会监督而言，由于信息不对称存在，公众对高等教育经费的监督多流于形式。因此，构建完善的经费监管机制是实现经费高效利用的基本保障。基于此背景，本文从财政理论和实践角度对高等教育经费监管机制进行了研究。理论方面，首先通过公共产品理论对高等教育经费进行定性，其次通过外部性理论说明政府对高等教育进行拨款的理由，再利用“委托-代理”理论阐释高等教育经费需要监督的理由，最后运用公平与效率理论明确对高等教育经费监管期望达到的目标。实践方面，本文主要从经费运行、监管情况、国际经验三个方面进行分析。首先通过实证数据，从经费来源、经费支出和运行绩效三方面，说明高等教育经费运行过程中存在的诸多问题。其次，从监管制度、监管体系、监管结果三方面，系统完善地对现阶段高等教育经费的监管情况进行梳理和展示。之后介绍了美国、英国、加拿大这三个国家高等教育经费的监管经验。通过对经费运行、监管情况、国际经验三方面的阐述，给出了中国高等教育经费监管机制的规范性标准，并据此提出了完善中国高等教育经费监管机制的政策建议。