胰腺癌侵袭性强,恶性程度高,预后极差。目前,胰腺癌诊断十分困难,影像学检查如CT、核磁共振成像(MRI)、超声内镜检查术(EUS)等受检查设备及医生的经验和技术水平的影响较大;细针抽吸活检结合病理检测是目前胰腺癌诊断的金标准,但由于胰腺位置隐蔽、血管丰富,抽吸操作困难,容易引发严重并发症,并且存在抽吸位置不准确和抽吸量不足等问题,导致其诊断敏感性较低;一些临床常用的分子标志物如KRAS基因突变、血清CA19-9等均存在敏感性或特异性不足的情况。此外,随着DNA芯片技术和高通量基因测序技术的发展,产生了大量的胰腺组织表达谱数据,很多研究利用这些表达谱数据来识别胰腺癌的转录组定量诊断标志,但由于受批次效应和样本质量问题如mRNA的部分降解和微量扩增等的影响,这类标志很难转化到临床应用。有研究表明基于基因表达水平相对秩次关系(REO)建立的转录组定性标志更加稳定,对批次效应和样本质量问题不敏感,无需数据标准化,可适用于多个平台检测的样本。本研究的目的是利用胰腺癌基因表达谱,识别一个能有效区分非癌样本(包括正常样本和慢性胰腺炎样本)与胰腺癌样本的转录组定性诊断标志,能适用于临床取样位置不准确或取样量不足的情况,以及不同检测平台的基因表达谱数据。我们利用来自Affymetrix平台和Illumina平台检测的五套数据集作为训练集,共包含了49个正常样本,60个慢性胰腺炎样本,326个手术切除的胰腺导管腺癌样本以及145个手术切除的胰腺癌癌旁“正常”样本。将正常和慢性胰腺炎合并为非癌组,胰腺导管腺癌样本与癌旁“正常”样本合并为癌症组。首先,计算非癌组与胰腺导管腺癌样本85%高度稳定逆转基因对,共得到2557个基因对。然后,计算每一对的分类效能(F_score)并将其从高到低排序,基于半数投票规则计算前n对(1≤n≤2557)的F_score。当n为6时,其F_score达到最大值。因此,我们将前6个基因对作为胰腺癌的诊断标志。最后,将该标志在公共数据库的8套独立数据集(主要为手术切除样本,其中两套数据集含活检样本)中进行验证,结果显示该标志对多套独立数据集分类效能良好。对于手术切除样本,该标志在正常、炎症、胰腺导管腺癌样本中的总体分类准确率分别为:95.83%(23/24)、100%(11/11)、96.34%(316/328),并且我们的标志能将大多数的癌旁“正常”样本识别为癌症,总体的特异性和敏感性分别为97.14%、96.81%。对于胰腺导管腺癌活检样本,该标志在TCGA的28个活检样本中的准确率为100%(28/28);在GSE42952的23个活检样本中准确率为95.65%(22/23)。本研究识别的标志在Affymetrix、Illumina和Agilent三种不同检测平台中都可以较为准确地识别出正常、慢性胰腺炎等非癌样本和胰腺癌样本。同时,该标志也能将取样不准确的癌旁组织样本准确识别为癌样本,并且在活检数据中也有较好的分类效能。因此,本研究识别的标志有望可以辅助当前的胰腺癌活检诊断,提高诊断准确率。