2012年1月1日，新医院会计制度开始在全国施行，这有利于提高医院会计信息质量，增强财务透明度，为医院管理层、政府、监督机构等医院财务分析报告使用者提供更加可靠、相关的会计信息。财务分析是指运用经营管理计划、财务报表、统计数据及其他资料，对一定时期内的财务收支状况、经营活动过程进行研究和比较分析，并进行总结和做出相应评价的一种方法。新制度的实施在给会计信息带来了颠覆性变化的同时也给医院财务分析提出了新的挑战，理解并掌握新旧制度差异及其对财务分析的影响，采用相应的建议和对策对医院财务人员具有至关重要的意义。　　本文首先采用规范研究的方法论述医院财务分析的主要内容和重要性，并从一般性原理分析会计制度对财务分析的影响，然后在对比分析新旧会计制度差异的基础上，从核算基础、使用范围、会计要素和财务报告体系等方面突出了新制度的优越性。其次，以S医院为例分析了新制度对医院财务分析内容、方法和指标体系的影响。最后，从新医院会计制度与企业会计制度趋同出发，借鉴杜邦分析法和平衡记分卡法等方法，提出将财务分析预警机制和财务报告引入注册会计师审计模式，为财务人员在新制度下的财务分析工作提供了更详细、更全面、更全面的建议和对策。本文通过医院财务分析理论与案例医院实际情况相结合的研究思路，对新医院会计制度对公立医院财务分析的影响进行了全面的分析，得出了新医院会计制度对公立医院财务分析在广度和深度上的拓展产生了深远影响这一结论，要成功应对这一变革，除了需良好地掌握新医院会计制度之外，还要通过借鉴企业财务分析方法等手段对财务分析工作不断改进和完善。