在我国政府“实现农业农村现代化,增强农村活力发展”的号召下,农业在国民经济中的重要地位愈发明显。农业上市企业作为农业产业发展的主体,引领我国农业经济的发展。而对于我国农业经济的发展,政府制定了一系列财税扶持政策。因此为了提高农业上市企业的研发投入和盈利能力,为政府的财税扶持政策提供一个良好的政策环境,本文从农业上市企业的角度研究财税扶持政策对企业的研发投入的刺激力度、企业盈利能力的提升力度,研究结果可以从不同角度为政府制定政策提供合理范围参考。本文主要采取理论和实证分析相结合的方法进行研究,研究内容主要涵盖以下几个方面。首先介绍财税扶持政策中税收优惠、政府补助的特点,并且从农业企业近几年的发展状况数据及税收贡献发现农业企业在不同行业的发展存在较大差异。其次从农业具有的弱质性、外部性理论角度出发,分析发现农业正处于行业劣势,所以国家必须对农业加大扶持力度,促进行业健康稳步发展。但是通过整理当前财税政策发现,在制定和实施过程中存在一些问题,从而没有达到政策预期效果。最后基于农业上市企业79家的财务数据建立个体年份双固定效应模型和中介效应模型分析政策的实施效果。通过分析发现有以下结论:（1）财税扶持政策中增值税和政府补助能直接促进企业的盈利能力。（2）税收优惠和政府补助均能刺激企业的研发力度,而企业所得税的促进效果最好,且企业所得税和政府补助在中型企业的研发投入中发挥重要性作用。（3）研发投入是财税扶持和盈利能力的中介变量。（4）增值税和企业所得税以研发投入为路径间接促进企业的盈利能力。基于以上结论分析,本文在最后一章对当前实施的财税扶持政策体系提出以下建议:（1）实施差异化财税扶持政策;（2）合理利用财税优惠资金;（3）税收优惠政策为主,政府补助为辅。