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狼蛛是骨骼肌结构与功能研究的重要模式生物,然而目前公共数据库中还没有狼蛛肌肉蛋白质或基因序列。
本课题构建了狼蛛Aphonopelma sp.骨骼肌标准cDNA文库,随机挑取克隆测序,得到2507条高质量5'EST,序列分析得到305个unigenes,其中81个由2个以上的EST组成。与骨骼肌特异基因有匹配的共有20个高丰度的unigenes,包括肌动蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白,肌钙蛋白I,肌钙蛋白T,肌钙蛋白C,副肌球蛋白,肌肉LIM蛋白,肌肉蛋白20,α辅肌动蛋白,串列免疫球蛋白/纤连蛋白基序(见于巨大肌小节相关蛋白)。肌球蛋白轻链激酶以及calponin同源序列也有表达。这些结果支持狼蛛骨骼肌收缩既受肌动蛋白关联的调节,也受肌球蛋白关联的调节。
基于上述的5'EST,并结合3'EST测序、引物步移测序与生物信息学分析,本研究预测了肌肉特异性蛋白的全长以及局部cDNA序列,推导其编码的多肽,并对这些多肽的结构功能特性做了初步分析。结果表明狼蛛肌球蛋白调节轻链有主要异型体与次要异型体,两者分子量不同,但均比脊椎动物调节轻链大,差别主要在于N端序列,除了N端以外基本结构相似,均具有调节轻链的典型结构特征,分别预测到两个与三个肌球蛋白轻链激酶磷酸化位点;肌球蛋白必需轻链有两种以上异型体,与非脊椎动物必需轻链类似,未见扇贝必需轻链中保守的钙结合残基;狼蛛骨骼肌中至少有4种肌球蛋白头部的异型体以及两种主要的尾部异型体,序列特征均符合Ⅱ型即传统肌球蛋白重链,目前还没有得到完整的S1、S2或LMM区序列;狼蛛骨骼肌中主要有两种肌动蛋白异型体,主要异型体是肌肉型异型体,另一种为细胞质异型体,均跟果蝇肌动蛋白细胞质异型体更加相似,提示鳌足类动物肌动蛋白的肌肉异型体特征性残基与昆虫存在差异。狼蛛肌钙蛋白C至少存在两种异型体,狼蛛肌钙蛋白C主要异型体第Ⅱ个与第Ⅳ个EF手可能具有Ca2+结合活性;狼蛛肌钙蛋白Ⅰ发现有三种异型体,均与非脊椎动物肌钙蛋白Ⅰ的最小抑制性肽段区都有较高的同源性,可能是同一基因的选择性剪接产物;狼蛛骨骼肌中至少有2种肌钙蛋白T异型体,主要异型体的N端较短,C端序列富含谷氨酸以及甘氨酸与脯氨酸,与其他物种肌钙蛋白T差异较大;狼蛛骨骼肌中至少有2种原肌球蛋白异型体,可能来自于单个基因的选择性剪接。
狼蛛骨骼肌中多种异型体的存在支持以往肌肉序列研究所表明的肌纤维蛋白异型体存在的普遍性,可能跟狼蛛骨骼肌多种肌纤维类型的存在有关。EST数目所反映的肌钙蛋白C:肌钙蛋白I:肌钙蛋白T,肌球蛋白重链:调节轻链:必需轻链,以及副肌球蛋白:肌球蛋白的摩尔比跟节肢动物现有的实验所得蛋白质比率不同,可能由于不同异型体的存在所致。
本研究为狼蛛骨骼肌转录组研究、狼蛛蛋白质的体外表达、结构与功能特性的解释打下了基础。