资本结构是衡量上市公司财务状况和经营能力的重要方面,公司资本结构是否合理直接关系到其生产经营活动能否顺利进行,关系到公司的盈利状况,关系到公司的生存与发展。因此公司要有竞争力,必须要有良好的资本结构支持其健康发展。同样,生物医药业上市公司要想获得健康、持续地发展,优化其资本结构是关键。为了对我国生物医药业上市公司的健康发展提出建设性的意见,本文重点研究生物医药业上市公司资本结构对公司绩效的影响以及是否存在最优资本结构的问题。本文首先对资本结构与公司绩效的概念进行界定,并引入了资本结构与公司绩效的相关关系理论。其次从产业的角度出发,以我国生物医药业上市公司为研究对象,采用描述性统计方法对生物医药上市公司资本结构与公司绩效的现状及特点进行了较为详细的数据分析,分析得出我国生物医药业上市公司资本结构具有资产负债率总体水平偏低、债务结构不合理、股权集中度高但股权制衡效果差的特征。接着根据以往学者的研究成果,同时结合本文的现状分析,提出实证假设和建立回归模型。然后本文选取108家生物医药业上市公司2008年—-2010年期间的324个样本数据对资本结构与公司绩效的关系进行实证分析；在公司绩效指标的选取和评价方面本文借鉴了国资委公司绩效评价体系,从公司的盈利能力、经营能力、偿债能力和发展能力四个方面综合考虑公司绩效,并选取了9个绩效指标进行衡量。然后运用因子分析法对这9个指标进行分析,根据因子得分计算出反映我国家生物医药业上市公司的经营绩效指标。最后,以资产负债率、流动负债率、第一大股东持股比例和前五大股东持股比例作为解释变量,以公司绩效综合指标作为被解释变量,以公司规模和成长性指标作为控制变量,对生物医药业上市公司资本结构与公司绩效之间的关系进行实证研究,并对实证结果进行分析。实证研究结果表明：我国生物医药业上市公司的资产负债率和公司绩效呈显著的正相关,而流动负债率和公司绩效之间并没有显著性关系；前五大股东持股比例与公司绩效呈显著的正相关关系,而第一大股东持股比例和公司绩效之间的关系并不显著；作为控制变量的公司规模以及公司成长性和公司绩效呈显著的正相关关系；而就2008年一2010年3年间的面板数据而言,生物医药业上市公司并不存在最优资本结构区间。最后根据实证分析结果,本文提出优化我国生物医药业上市公司资本结构的对策建议。