介导手术后急性疼痛的潜在核心基因鉴别

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目的:利用生物信息学探寻介导手术后急性疼痛的核心基因(hub基因),从基因组学水平揭示手术后疼痛的分子机制,为患者的疼痛治疗提供依据。方法:从高通量基因表达数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载了基因数据集GSE125076并整理分析,使用R语言的相关程序包进行基因差异表达分析和可视化分析,利用David在线工具进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,利用miRNet和比较毒理学数据库CTD预测疼痛相关基因,再利用基因、蛋白质相互作用关系检索工具(String)数据库、比较毒理学数据库(CTD)和Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建和hub基因筛选。结果:通过对GSE125076数据进行分析,GSEA分析结果为ATP合成与电子传递、电压门控钙通道活性、AMPA受体活性调节等生物学过程;基因差异表达分析共得到934个差异基因,其中表达下调的基因193个,表达上调的基因741个;差异表达基因的GO功能主要富集在炎症反应、脂质结合、谷胱甘肽转移酶活性、ERK1和ERK2级联的正调节等。基因筛选得到上调表达的8个hub基因GNG5,F2RL1,GCG,EDN1,MMP9,LRG1,SERPINE1,TIMP1。结论:基因 GNG5,F2RL1,GCG,EDN1,MMP9,LRG1,SERPINE1,TIMP1 可能参与了术后急性疼痛的发生,可能成为急性疼痛治疗的潜在靶点。
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