基因C8orf76在乳腺癌中的预后、免疫及药物敏感性分析

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目的 分析C8orf76基因对乳腺癌(Breast cancer,BC)预后,免疫相关作用和抗癌中药单体的药物敏感性的影响。方法 从TCGA数据库中下载BC的基因表达数据和临床特征数据;通过Limma包筛选出差异表达基因;R软件筛选出目的基因;通过survival程序包进行生存分析,结合临床特征对目的基因进行单因素、多因素cox分析;通过ROC分析、诺莫图分析对目的基因进行预后分析;通过ssGSEA分析确定目的基因与免疫细胞及免疫功能的相关性;MTT检测细胞活性进而分析C8orf76对中药单体药物敏感性的影响;分析目的基因与8个免疫检查点的相关性;KEGG进行通路富集分析;通过GEPIA对目的基因进行验证;获取2020年1月到2021年12月共30例BC患者的手术肿瘤切除样本和癌旁组织样本,进行免疫组化分析。结果 经筛选后获得4582个差异表达基因,其中上调基因2628个,下调基因1954个;经生存及临床病例相关性分析后,获得158个差异表达基因,选择C8o rf76基因进行后续研究,分析后发现C8orf76在BC组织中高表达;临床病例相关性分析结果显示,C8orf76的表达与BC肿瘤患者Stage分期和N分期显著正相关,与患者年龄、T分期和M分期无关;生存分析结果显示,C8orf76的高表达缩短了 BC患者的生存时间;单因素、多因素cox分析结果显示,C8orf76和Age,Stage,T,M,N可作为独立预后因子;ROC结果显示,AUC大于0.5,C8orf76基因具有较好的诊断价值;免疫相关性分析结果显示,aDCs、Tfh、Th 1cells、Th2cells等免疫细胞的富集分数在C8orf76高表达组中更高,而iDCs、Mastcells则更低;免疫功能中TypeⅡIFNReponse的富集分数在C8orf76高表达组中更低,其余免疫功能的富集分数均在C8orf76高表达组中更高。免疫检查点中 CD86、CD274、PDCD1LG2、TIM-3 和 LAG3 在 C8orf76 高表达组和低表达组中的表达均差异显著,其中CD86、CD274、TIM-3、PDCD1LG2在C8orf76高表达组中表达较低;LAG3在C8orf76高表达组中表达较高;KEGG分析发现,C8orf76主要与氨基糖/核苷酸糖代谢、精氨酸/脯氨酸代谢、果糖/甘露糖的代谢、氧化磷酸化等通路相关;并且下调BC细胞(MDA-MB-231)中C8orf76的表达量能够增强BC细胞对抗癌中药单体的药物敏感性;GEPIA数据库验证分析结果显示,C8orf76的高表达与BC患者的不良预后相关;且该基因在BC肿瘤组织中高表达,诊断价值良好;免疫组化结果显示,C8orf76在BC组织中高表达,癌旁组织中低表达。结论 C8orf76基因在BC组织中高表达,该基因能够调节乳腺癌患者的免疫细胞及其免疫功能,对相关免疫检查点具有调节作用,下调该基因的表达量能够增强BC细胞对抗癌中药单体的药物敏感性,从而影响BC患者的预后。
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