具有自噬相关基因的较低级别胶质瘤临床预测模型的建立与验证

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ppasu
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目的:较低级别胶质瘤(LrGG)由低级和中级神经胶质瘤组成,其临床行为变化很大。他们中有些惰性程度很高,而另一些则迅速发展为成胶质母细胞瘤。最近的研究表明,自噬与LrGG的预后密切相关。迫切需要一种包含自噬相关基因的生存列线图以预测LrGG的预后,为后续治疗提供咨询和风险评估。方法:从中国胶质瘤基因组图谱(CGGA),癌症基因组图谱(TCGA)中获取较低级别胶质瘤以下变量:肿瘤等级(II或III)、病理、年龄、性别、放疗状态、化疗状态和IDH1亚型。自噬相关基因可从人类自噬数据库(HADb)下载。通过生存过滤分析构建自噬风险评分公式,再使用Cox比例风险回归构建Nomogram列线图。这些模型是使用CGGA数据开发的,并使用TCGA的数据进行独立的外部验证。使用10倍交叉验证对模型进行内部验证,并使用校准曲线进行外部验证。结果:开发了列线图模型,使用训练集中的8个变量预测较低级别胶质瘤患者的1年、3年、5年和10年总生存率:肿瘤等级,病理,年龄,性别,放疗状况,化疗状况,IDH亚型和自噬相关的基因风险。用于内部验证的一致性指数(C指数)和时间相关的接收者操作特征(ROC)(根据训练集用于预测总生存期的列线图)为0.778,用于外部验证(验证集)的C指数为0.816。校准图的结果表明,通过列线图获得的实际观测值和预测值在两组之间具有良好的一致性。结论:我们已经开发了一种现成的列线图模型,该模型包括可预测总生存期的临床特征。列线图可以为LrGG患者的后续治疗提供咨询和风险评估。并提供了用于实施此列线图的免费在线网页:https://cdd1152.shinyapps.io/LrGGNomappC/.
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