河北省部分地区IBV分子流行病学调查及qPCR方法的建立

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tangroo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)可感染鸡呼吸、消化、泌尿及生殖等系统,在临床上表现出较广泛的组织嗜性,IBV引发的传染性支气管炎(Infectious bronchitis,IB)可使鸡增重减慢、饲料报酬降低、产蛋量和蛋品质下降,给养鸡业带来了巨大威胁。目前中国流行的IBV存在多种基因型,其中以LX4基因型为主,国内分离的多数IBV与常用疫苗毒的基因型和血清型均不同;高频率的重组加速了 IBV变异株的出现。近年来河北省鸡群也常发生IB。本研究拟从临床收集的病料分离、鉴定IBV,对IBV分离毒M蛋白基因、S1蛋白基因和全基因组进行遗传变异分析,用代表毒株接种SPF鸡,建立1种针对IBV M蛋白基因的实时荧光定量PCR方法,旨为了解河北省IBV的流行态势变化及为IB的防控提供有益参考。从河北省部分地区收集的病料中分离、鉴定到20株IBV。遗传变异分析结果表明,20株IBV分离毒M蛋白基因编码区长678或681 nt,分别编码225或226个氨基酸;与45株参考毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为85.4%~100%和86.7%~100%;均与疫苗毒YX10 D90 vaccine株亲缘关系较近;均与疫苗毒H120、H52、Connecticut株等亲缘关系较远。20株IBV分离毒S1蛋白基因编码区长1608/1611/1620 nt,分别编码536/537/540个氨基酸;与45株参考毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为60.6%~99.3%和 49.2%~98.9%。20 株 IBV S1 蛋白裂解位点模式为HRRRR/HRRKR/HRHRR;均属I群中的 LX4(QX)型 IBV,均与疫苗毒 YX10 D90株亲缘关系较近;与III群中疫苗毒ArkGAP1、Connecticut、H120、H52株亲缘关系较远。全基因组序列分析结果表明,ck/CH/HB/20株基因组全长为27672 nt,具有典型的IBV基因编码特征。遗传进化分析结果表明,ck/CH/HB/20株与QX型SC/SDL/19株和LX4型CK/CH/LAH/1806株亲缘关系最近;与疫苗毒YX10 D90株亲缘关系较近;与疫苗毒4/91、H120、H52株等亲缘关系较远。SPF鸡人工接种试验结果表明,接种IBV分离毒的6组鸡临床症状、剖检病变均与文献报道相似;6株IBV分离毒接种鸡的排毒持续期长短不一,泄殖腔排毒时间比呼吸道长。ELISA检测结果表明,这6组鸡中最早检测到IBV抗体的时间为7 dpi,最晚为28 dpi,但接种IBV分离毒的6组鸡的IBV抗体阳性持续期长短不一。这表明6株IBV分离毒均可复制IB模型。整个试验期内,空白对照组均未见临床症状、采集脏器均无肉眼病变;采集棉拭子样品均呈IBV阴性;采集血清样品均呈IBV抗体阴性。研究表明,针对IBV M基因建立的TaqMan荧光定量PCR方法仅可特异性扩增IBV,但对H5、H7和H9亚型AIV及NDV均无扩增信号;其最低检测限为10 copies/μL,常规PCR最低检测限为1.0×102 copies/μL;重复性结果良好;应用结果显示,该方法对临床病料中IBV的检出率为42%,常规PCR检出率为39%。
其他文献
近年河北部分地区鸡群小肠黏膜出血病变渐增多。本研究对2019年1月-2020年12月河北部分地区有出血病变的小肠进行了细小病毒(Parvovirus,PV)、禽肾炎病毒(Avian nephritis virus,ANV)、鸡星状病毒(Chicken astrovirus,CAstV)、禽腺病毒(Fowl Adenovirus,FAdV)、轮状病毒(Rotavirus,RoV)、传染性支气管炎病毒
学位
目的:探究孕期酒精暴露对后代新生大鼠大脑发育的影响及生后早期给予不同剂量外源性甲状腺素对其的改善作用。方法:选取60只雌性SPF级SD大鼠,随机分为酒精暴露模型组(A组)、酒精暴露模型+低剂量甲状腺治疗组(A+T2.5组)、酒精暴露模型+中剂量甲状腺治疗组(A+T5.0组)、酒精暴露模型+高剂量甲状腺治疗组(A+T7.5组)、正常对照组(N组)共5个实验组以及每个实验组对应的代理母鼠组。自大鼠怀孕
学位
由致病性大肠杆菌所引起的犊牛腹泻是犊牛最为常见的疾病之一,如果不及时治疗或合理用药,严重时会引起犊牛死亡,将给养牛业带来巨大的经济损失。为更好地了解保定地区大肠杆菌性犊牛腹泻的流行情况,本试验对该地区规模化牛场进行有针对性的流行病学调查,在对病原体进行分离鉴定的基础上,进行了血清型鉴定、毒力基因检测、小鼠致病性试验、体外药物敏感性试验及耐药基因检测等试验,以便为该病的预防与治疗提供依据。本试验对保
学位
由于“禁抗,限抗”措施的实施,越来越多的人开始探索替抗物质和替抗策略,芽孢杆菌凭借其诸多优势被作为益生菌应用到畜禽养殖业,本试验从蚯蚓肠道内分离一株菌,经过理化鉴定、分子生物学鉴定等手段确定其种属,通过药敏试验、抑菌试验、抗逆性试验、安全性试验等探究筛选菌株的安全性,用该菌发酵蚯蚓产物饲喂育肥猪,探究发酵产物对猪生产性能、抗氧化及免疫功能的影响,为畜牧养殖业生产新型微生态制剂提供思路。从蚯蚓肠道内
学位
非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASF virus,ASFV)引起猪的一种急性、热性、高度接触性传染病,病死率高达100%。2018年,该病在我国首次暴发,并迅速在国内蔓延流行,给国内的生猪生产造成了极大的经济损失。目前,ASF仍然反复发生,防控形势十分严峻。ELISA是快速检测、筛查和净化ASFV感染猪的重要技术手段,但国内尚缺乏理想的ELISA检测试
学位
为了研究具有广谱抗病毒且能够提高机体免疫水平的鸡基因工程制剂,本研究表达了鸡白介素2(IL-2)和鸡干扰素α(IFN-α)融合蛋白,探究了融合蛋白在体外的生物学活性,从而为融合蛋白在临床上的推广和应用提供科学依据。本研究根据GenBank上登录的鸡IL-2(AF000631)和IFN-α(EU937528)天然基因序列,对天然基因序列进行信号肽的预测。在不改变天然基因序列所编码的氨基酸的条件下,利
学位
目的:探讨经皮肝胆囊穿刺引流术对于治疗高危高龄急性胆囊炎的临床价值方法:回顾性分析2016年1月1日至2018年12月31日于延边大学附属医院肝胆胰脾外科住院治疗的165名高危高龄急性胆囊炎患者,74位患者选择行PTGBD,70位患者选择行ELC,21位患者选择保守抗菌治疗。因此将单纯行PTGBD的患者分为观察组1,先行PTGBD治疗后行DLC治疗的患者为观察组2,选择保守抗菌治疗,未行手术的患者
学位
在畜牧养殖行业禁抗减抗的大背景下,新型饲料添加剂的开发成为了当前研究热点。其中,乳酸菌等益生菌也逐渐被开发利用,发挥其功能效果。本试验从蚯蚓体中分离出植物乳杆菌(Lactobacillusplantarum,Lb.plantarum)、乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici,P.acidilactci)和肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides,Leu
学位
修复和重构动态平衡的矿山生态系统,既是绿色矿山建设的重要理论基础,也是维护和保障矿山经济健康持续发展的重要措施。虽然受矿产与矿山种类、采矿方式、自然地理等因素的制约和影响,使得矿山生态修复和矿山生态系统动态平衡重构非常复杂,但究其关键主要在于不同植物品种对矿山废弃地土壤改良效果之间复杂关系问题的解决。为此,在河北省铁矿山大宗铁尾矿造地利用的典型案例的调查研究的基础上,选取代表性铁尾矿砂质混合土壤样
学位
生态环境安全是国家安全的重要组成部分,是社会健康发展的主要内容之一。在始终坚持生态文明理念的背景下,高度重视并降低生态环境风险,是生态文明建设的主要内涵。土地整治作为国家层面的战略部署,对生态环境的影响也逐渐引起学者关注。本文选取阜平县作为研究区,通过ENVI对三期遥感影像数据进行解译,得到2010、2015、2020年土地利用数据,并以此为基础,对阜平县的土地利用类型进行了研究,明确了其变化特征
学位