O-GlcNAc糖基化修饰化学酶法标记及体外酶法合成L-阿拉伯糖糖基供体的研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangzhaodsg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
O-GlcNAc糖基化及最近发现的相关的6位带有磷酸基团的O-GlcNAc6P修饰是目前蛋白糖基化研究的热点之一。在O-GlcNAc的研究中,化学酶法糖标记(Chemoenzymatic glycan labeling)是近年来开发的有效研究方法。这种方法利用一种糖基转移酶(BGalT-Y289L)的特定底物特异性对O-GlcNAc结构中的GlcNAc进行糖链衍长,再通过引进的带有化学反应手柄的单糖衍生物进行下一步的点击化学反应,从而添加上检测标签比如荧光基团或亲和标签比如生物素等。BGalT-Y289L是一种牛来源的半乳糖基转移酶(GalT)的突变体,目前主要通过大肠杆菌重组表达、包涵体复性获得,未能实现可溶性表达是其应用的一大阻碍。另外,研究发现,其它一些GalT 比如Helicobacter pylori来源的β1-4GalT(Hp1,4GalT)也有作为化学酶法标记工具酶的潜力。本论文的目标之一是使用大肠杆菌重组表达出可溶的、有活性的Hp1,4GalT和BGalT-Y289L,同时探索可以识别GlcNAc-6P的GalT。为此,论文第二章合成了 GlcNAc-S-pNP、GlcNAc-6P 及其衍生物 6P-GlcNAc-S-pNP,作为 GalT 的受体底物。第三章,对优化后的BGalT-Y289L与Hp1-4GalT编码基因序列进行了人工合成,获得了一系列BGalT-Y289L和Hp1,4GalT表达载体。对于Hp1,4GalT,目的基因与麦芽糖结合蛋白编码基因进行融合,大肠杆菌表达后获得了可溶的、有活性的目的蛋白。对于BGalT-Y289L,我们创新性的使用来自Staphylococcus hyicus的脂肪酶前肽片段作为融合标签与其进行融合表达,获得了可溶的、有活性的目的蛋白。虽然研究结果表明两种GalT都不能以O-GlcNAc6P为底物,但两种GalT可溶性表达的实现为O-GlcNAc糖基化标记及相关糖链的合成提供了更易于获得的工具酶。论文第四章的研究内容涉及一种核苷酸糖合成方法的开发。核苷酸糖作为Leloir型糖基转移酶所必需的糖基供体,在糖链、糖蛋白、糖脂及糖修饰小分子酶促合成中必不可少。核苷酸糖对这些糖类化学物的合成、修饰、改造及其在医药等领域的应用具有重要价值。L-阿拉伯糖广泛存在于植物和微生物细胞结构中,是植物中第二丰富的戊糖。尿苷二磷酸阿拉伯糖(UDP-阿拉伯糖)是阿拉伯糖基转移酶的供体底物,是生物体中含L-阿拉伯糖的糖类化合物合成的必需前体。目前,已有一种化学及酶催化结合的方法制备UDP-阿拉伯糖,其特征是先通过化学法合成阿拉伯糖-1-磷酸,再通过拟南芥来源的UDP-糖焦磷酸化酶AtUSP以化学合成的阿拉伯糖-1-磷酸为底物合成UDP-阿拉伯糖,此方法中化学合成的阿拉伯糖-1-磷酸为混合物,包括β-L-吡喃阿拉伯糖-1-磷酸和-αL-吡喃阿拉伯糖-1-磷酸,两者难以分离,而AtUSP只能利用β-L-吡喃阿拉伯糖-1-磷酸为底物,所以此方法具有化学反应步骤多不经济不环保、酶反应效率低、先化学合成再酶反应耗时长等问题。为此,论文第四章,我们由微生物Paludisphaera borealis中筛选到一种具有阿拉伯糖激酶活性的单糖激酶PbAraK,实现了其重组表达,并对其单糖底物适应性、最适反应条件进行了探索。结果表明,PbAraK可以识别L-阿拉伯糖及L-核糖合成相应的糖-1-磷酸;研究还发现此酶和其他单糖激酶类似,具有金属离子依赖性,确定了其最适反应温度为45℃,最适pH为7.5-8.0。在此基础上,结合AtUSP(EC 2.7.7.64)和无机焦磷酸酶(EC 3.6.1.1),建立了一锅三酶生物合成UDP-阿拉伯糖的方法。较化学合成阿拉伯糖-1-磷酸相比,PbArak酶法合成步骤简单、经济高效,适用于阿拉伯糖-1-磷酸及UDP-阿拉伯糖的规模化制备,具有潜在应用价值。
其他文献
中国共产党第十八次全国代表大会以来,检察机关作为法律监督机关总结经验、吸取教训,采取了很多有效措施和机制防范刑事错误瑕疵案件的发生。检察机关刑事申诉检察部门,在办理大量刑事申诉和国家赔偿案件的基础上,积极开展反向审视探索和实践,拓宽检察监督渠道,以求司法办案人员最大限度地减少刑事错误瑕疵案件,从源头上预防涉法涉诉信访案件的发生。但实务中,检察机关反向审视工作面临着不积极、不规范、不统一等问题。检察
学位
大数据时代,数据特别是商业数据的巨大经济价值日益被人们所关注,有人称其为“未来的新石油”。伴随着商业数据高速发展和深度应用,商业数据引发的数据权利属性、权利分配、保护路径之争等也急需法律对其作出回应。本文围绕实务界和理论界关注的商业数据法律属性、权利性质、权益归属和法律保护机制等问题,在前人研究的基础上,进行了进一步探讨:从权利保护的角度出发,认为商业数据应该上升到权利保护的层次进行保护,并进行了
学位
本文在借鉴国内外相关研究成果的基础上,通过亲身教学、课堂观察、访谈和问卷调查等方法,以泰国南奔颂恩国立中学的高中生和教师为研究对象,对泰国学生汉语课堂问题行为进行了研究。本文在调查中发现,泰国学生在汉语课堂上的问题行为主要为害怕老师点名提问、互相抄袭作业、上课打瞌睡、玩手机、交头接耳等一些典型的问题行为。在泰国教师与中国志愿者教师的汉语课堂中学生的表现是有区别的,由于中国志愿者教师年纪较轻、经验不
学位
本论文在“健康中国”国家战略背景下,重点研究四种健身气功功法与陈氏太极拳的健身之“理”,分别从两者的健身机理、文化意理、技术功理的异同进行分析,从而得出两者的优势,以满足不同学练者的健身需求。健身气功与太极拳学练群众交叉互联,通过对比分析提炼两者具有代表性的核心技术动作,为满足学练者个性化的健身需求提供理论与实践依据,努力实现两种民族民间传统体育项目的同中存异,异中共荣的局面。综合对比四种健身气功
学位
今年是我国地球物理测井(简称测井)诞生50周年。在我国,最早建立电测井,随后建立核测井、声测井、热测井、气测井等。笔者撰写此文,通过对测井发展历程中某些首次事件的回顾和展望,纪念我国测井诞生50周年。
期刊
本翻译实践材料节选自《窃取财富:如何拯救金融化的世界》(Stolen:How to Save the World from Financialisation)一书的第五章。作者格蕾丝·布莱克利(Grace Blakeley)详细分析了2008年金融危机的始末,她认为产生危机的根本原因是金融化。当今,中国经济高速发展,经济的金融化不断深入,笔者将金融化相关书籍引入国内对国内金融业有一定警示作用,同时
学位
近年来,光催化技术在环境污染治理和能源开发利用方面得到普遍的关注,具有高效光催化活性的光催化剂的研发已成为当前国内外研究的热点。半导体光催化是当前治理环境污染的一种吸引人的方法,但是由于对太阳光的短波吸收和光生载流子的有效分离而受限。本文中我们通过水热法(HTG),原子层沉积法(ALD)和连续离子层吸附与反应法(SILAR)合成单层ZnO基异质结纳米线阵列和树状ZnO/Si基异质结纳米线阵列,并研
学位
培养学生的核心素养是新时期学校教育的重要教学目标,小学信息科技课程能够有效地激发学生的学习积极性,锻炼学生的思维能力及动手能力。互联网时代的快速发展促使小学教师充分利用线上线下教学资源,推动信息科技教学创新升级,以培养学生核心素养为目的,积极拓展教学方法,提高学生各方面能力。从目前小学信息科技课堂教学中存在的问题入手,提出几点优化建议,推动核心素养在小学信息科技课堂教学中的实践应用,提高小学生综合
期刊
观测发现,不少活动星系核的喷流呈现S形或Z形的反对称形态,这显示喷流可能在绕着某一轴线进动。采用喷流进动模型可以很好地拟合许多活动星系核的复杂图像。目前解释喷流进动的物理机制主要有双黑洞模型和盘致进动模型两类。前者中进动的喷流产生于星系核中的超大质量双黑洞系统,后者中则是产生于单黑洞和围绕黑洞的倾斜的吸积盘构成的系统。本文首先介绍了与课题相关的背景知识,然后从文献中收集到38个具有喷流进动周期和绝
学位
二维锡硒化合物是近年来新兴的IVA-VIA族半导体材料,其元素储量丰富、成本低廉、对环境友好,在工业化应用和可持续发展中有着巨大的优势。对于其中典型的SnSe和SnSe2层状结构材料,实验研究证实了其优良的光电和热电等物理特性,使其在光电探测、光伏应用、热电转换等方面拥有极大的应用潜力。本论文着眼于高质量二硒化锡和硒化锡二维晶体及其异质结构的可控制备,利用自行搭建的三温区化学气相沉积系统进行材料生
学位