单士元是我国著名的历史档案专家、建筑专家，从事过大量明清档案的整理活动，可以说，明清故宫档案能够较好的保存下来，里面有单士元的一份贡献。在大量的档案整理实践中，单士元逐渐形成了自己的档案思想。本文主要从单士元的档案整理活动和档案思想两方面，论述单士元与明清档案的渊源。　　单士元的档案整理活动主要分为建国前后两个阶段。在建国前，单士元参加了清代军机处、内阁大库、内务府等档案的整理，并发表了《总理各国通商事务衙门大臣年表》、《档案释名发凡》、《清代题本制度》、《清代奏事处考》、《清代起居注》、《清代秀女考》等文章;建国后，单士元除了参与对山东曲阜孔府档案的抢救外，还完成了《中国档案史讲义提纲》和《五国公使觐见中国皇帝交涉始末（史料辑要）》等文章。本文第二章以军机处档案、内阁大库档案和孔府档案三处为例，具体介绍单士元的档案整理活动。　　陈垣和沈兼士作为单士元的师长兼同事，两人的档案思想对单士元影响很大。本文第三章对单士元的档案思想进行总结，并探究其渊源。单士元的档案思想有:重视档案的史料价值;重视档案本身的历史研究;注重档案内容上的联系;重视档案的编纂、公布和利用;重视对档案以外其他史料的利用。　　第四章对单士元重要的代表作——《总理各国通商事务衙门大臣年表》和《档案释名发凡》的内容、意义进行介绍，并做出评价。这两篇文章集中体现了单士元的档案思想，具有很高的学术价值。《总理各国通商事务衙门大臣年表》被评价为“可以补旧史之阙，可以拾清史稿之遗”;《档案释名发凡》第一次提出了建立档案目录学的设想，成为此学科的导航之作。