松材线虫休眠相关基因daf-3、daf-9、daf-12、daf-16的克隆及其功能研究

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松材线虫,学名Bursaphelenchus xylophilus (Steiner&Buhrer),异名Bursaphelenchus lignicolus (Mamiya Y&Kiyohara)是一种重要的检疫性外来入侵物种,通过松墨天牛进行传播,是松属树种的毁灭性病害,给亚洲多个国家和地区造成巨大的经济损失。松材线虫的生活史分为繁殖阶段和扩散阶段,在特定条件下这两个阶段可以相互转换。这种特性有利于松材线虫在不良环境条件下保持较高的存活率,也有利于松材线虫随天牛传播扩散,但这种转换机制尚不明确。为了明确松材线虫繁殖型和扩散型转换的机制,本研究根据模式线虫秀丽隐杆线虫(Caenorhadits elegans)的滞育机制,以模式线虫滞育相关基因为基础,从松材线虫中克隆相关基因daf-3、daf-9、daf-12和daf-16,并分析基因在不同虫态和环境条件下的表达模式,并利用农杆菌介导灰葡萄孢菌表达松材线虫基因dsRNA的技术,敲低松材线虫daf-3、daf-9、daf-12、daf-16-1、daf-16-2基因的表达,并对其发育、繁殖量、寿命、脂肪积累等性状进行了统计,初步确定基因对松材线虫滞育的影响和作用,同时建立原生质体转化体系,成功敲除灰葡萄孢菌的Dicer-1基因,为以喂饲法介导RNA干扰研究松材线虫功能奠定基础。主要研究结果如下:1.采用RACE法从松材线虫中克隆与秀丽隐杆线虫滞育调控基因同源的daf-3、daf-9、daf-12和daf-16基因(daf-9、daf-12和daf-16基因登录号分别为GU256938、GU584879、JN628938、GU584878)。其中daf-3基因由9个外显子和8个内含子组成,属于MH蛋白家族;daf-9基因由6个外显子和5个内含子组成,属于细胞色素P450蛋白家族;daf-12基因含有6个外显子和5个内含子,属于核激素受体(NHR)蛋白家族;daf-16属于FOXO转录因子家族,存在2个基因即daf-16-1和daf-16-2,每个基因有2种剪接方式。在松材线虫基因组中daf-3、daf-9、daf-12和daf-16均为单拷贝基因。蛋白序列比对分析表明,松材线虫daf-3、daf-9、daf-12和daf-16基因分别与其同族基因具有高度保守性。2.分析了松材线虫繁殖型和扩散型中daf-9和daf-12基因的表达模式。Daf-9和daf-12在松材线虫不同发育时期和不同虫态中均有表达,但是在扩散型和繁殖型线虫中表达量变化较大。基因daf-9在扩散型Ⅲ龄线虫中表达水平极低,仅为繁殖型幼虫的1/10,而在扩散型Ⅳ龄幼虫中的表达量则与繁殖型幼虫持平。基因daf-12在扩散型Ⅲ龄线虫中表达水平与繁殖型幼虫基本持平,而在扩散型Ⅳ龄幼虫中表达量为扩散型Ⅲ龄的20倍以上,说明在松材线虫由繁殖型进入扩散型时daf-9基因大幅度下调,导致daf-12(NHR)缺少配体,而使松材线虫进入并保持扩散型Ⅲ龄。松材线虫此时出现积累脂肪,停止发育等表型,进入扩散型Ⅳ龄后,松材线虫daf-9基因恢复至繁殖型幼虫水平,daf-12基因大幅上调,daf-9利用松材线虫体内的固醇类物质合成DA,为daf-12提供配体。松材线虫由扩散型Ⅲ龄进入扩散型Ⅳ龄后,固醇类物质消耗掉而得不到补充,DA的合成再次被降低,使松材线虫维持扩散型Ⅳ龄幼虫。3.分析了松材线虫daf-3、daf-9、daf-12和daf-16基因在松材线虫应对外界不良条件(食物缺乏、高温、低温、种群密度增大)的表达模式。在温度适宜、食物充足、种群密度不大的条件下,松材线虫daf-3、daf-9、daf-12、daf-16基因均上调表达;在食物匮乏的情况下,松材线虫daf-3、daf-9、daf-12、daf-16基因均呈下调表达;当种群密度过大时,daf-3、daf-9、daf-12、daf-16基因均上调表达;低温时,daf-3、daf-12、daf-16-1基因呈上调表达,daf-9、daf-16-2基因呈下调表达;高温胁迫下,除daf-16-1基因略下调外,其它基因均上调表达。Daf-16-2蛋白在食物匮乏和低温胁迫下,大幅下调表达,而高温胁迫对其影响不大。4.构建了农杆菌介导转化在丝状真菌中表达dsRNA的载体PHD-RH,并利用灰葡萄孢菌介导表达松材线虫daf-3、daf-9、daf-12、daf-16-1、daf-16-2以及非靶性的sGFP基因的dsRNA,分别这些菌株连续培养松材线虫10代后(以转空载体的菌株为对照),分析松材线虫靶标基因表达量、发育速度、繁殖量、寿命、脂肪积累等表型。经过连续10代的RNAi处理松材线虫的靶标基因表达量下调近20倍,而sGFP基因dsRNA对靶标基因的表达没有影响;经daf-9、daf-12、daf-16-2基因RNAi处理后松材线虫发育速度显著低于对照(空载体),而经其它基因RNAi处理的线虫对其发育速度无影响;daf-9、daf-12基因RNAi处理的线虫繁殖量显著减少,而daf-16-1和daf-16-2RNAi处理的线虫繁殖量显著增加,经daf-3和sGFP基因RNAi处理的线虫对其繁殖量无影响;经daf-9、daf-12、daf16-1基因RNAi处理的线虫寿命显著增高,经daf-3、daf16-3、sGFP基因RNAi处理的线虫对其寿命无影响;经daf-3、daf-9、daf-12、daf16-1、daf-16-2基因RNAi处理的线虫脂肪含量均显著高于对照,而sGFP基因RNAi对松材线虫的脂肪积累量没有影响。5.建立灰葡萄孢菌原生质体转化体系,对灰葡萄孢菌Dicer-1基因进行同源敲除,获得了Dicer-1基因功能缺失的灰葡萄孢菌突变体,为更近一步利用灰葡萄孢菌表达松材线虫基因dsRNA研究松材线虫基因功能奠定了基础。
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