舜皇山国家森林公园地处我国重要的地理分界线——南岭山脉越城岭中段,是我国生物多样性丰富的地区之一。但迄今为止,还很少有人对舜皇山生物多样性进行系统的调查研究。为了了解舜皇山国家森林公园的动植物种类组成、区系特点及珍稀濒危动植物物种,为合理保护与持续开发利用舜皇山多样性提供理论依据,我们于2008年1月至2009年6月对舜皇山进行系统调查,并结合前人的研究,对舜皇山多样性及其保护进行分析和评价,结果表明：1、舜皇山有高等植物223科,921属,2368种。与湖南全省高等植物比较科占全省的84.8%,种占全省的42.5%；舜皇山共有保护植物40种,其中一级保护5种,二级保护35种；区系分析表明,舜皇山种子植物分为15属,其中泛热带分布有152属,占总属数的19%,居第一位,其次是北温带分布属、东亚分布属、热带亚洲分布属、东亚和北美洲间断分布属、世界分布属等,体现了中亚热带植被的独特性质。2、舜皇山现已有陆生脊椎动物262种,隶属4纲28目77科。占湖南省陆生脊椎动物632种的38.29%。有国家一级保护5种,二级保护35种。在区系分布上东洋界种类有195种,占物种总数的74.43%；古北界种类36种,占13.74%；广布种31种,占11.83%。另外有水生脊椎动物鱼类33种,隶属4目13科。昆虫有17目156科759属1163种,约占湖南全省正式发表的昆虫种类4881种的23.83%。3、雪灾使该区生物多样性显著下降,特别是对森林植被和森林景观的影响显著。4、从物种丰富度、生态系统类型多样性、植被垂直层谱的完整性、物种特有性和外来物种入侵度五个方面对生物多样性进行了评价,结果表明舜皇山生物多样性属于良。5、对舜皇山生物多样性保护面临的主要威胁以及限制因素进行分析的基础上,提出了各种科学合理可行的保护对策,以促进生物多样性的有效保护。