目的：本研究通过比较改良swenson和soave两种先天性巨结肠根治术式的治疗效果及术后并发症等，探讨两者的优缺点及各自适应症，总结手术经验，为临床选择合适的手术方式提供参考依据。　　方法：采集我院小儿外科2009年1月至2013年12月间经手术及病理确诊并获得随访的先天性巨结肠患儿资料52份，其中采用改良Swenson手术治疗的患儿29人，采用soave手术治疗的患儿23人。病案室查阅相关数据，统计两组患儿的手术年龄、手术时间、术中失血量、术后留院时间、术后并发症，电话配合门诊复查随访患儿术后的肛门排便功能及生活质量，并将两组手术资料做统计学量化比较，进行回顾性分析研究。　　结果：改良swensom手术组患儿年龄最小3月，最大16岁，平均3.65岁；术中失血量最少20ml，最多200ml,平均92.40ml；手术时间最短2小时，最长6小时30分钟，平均4小时10分钟；术后留院天数最短9天，最长44天，平均16.96天；术后并发吻合口瘘3例，小肠结肠炎3例，血尿1例，血便1例，吻合口狭窄1例，术后顽固性便秘消失，污粪少。改良soave手术组患儿年龄最小7月，最大4岁6月，平均年龄1岁8月，术中失血量最少20ml，最多120ml，平均73ml，术后留院天数最短8天，最长19天，平均13.81天，术后并发症少，但肛门污粪偏多。　　结论：两种手术方式均可有效治疗婴幼儿先天性巨结肠，解决便秘问题。改良swenson术后有肠瘘风险，但污粪少，年龄跨度较大；改良soave术后污粪较多，肠瘘风险小，婴幼儿多。后者在手术操作难度、手术年龄、复杂性方面较占优势。Soave手术因在本院开展较晚，随访时间较短，污粪情况是否虽年龄增长逐渐好转尚待观察。对手术方式的选择应根据患儿年龄、病变肠管长度及手术者经验综合考虑。