《中央企业混合所有制改革操作指引》的出台,使国有企业混合所有制的改革不断深入,企业创新是国有企业改革需考虑的根本前提,关于国有企业混合所有制改革与企业创新研究成为热点话题,目前聚焦于股权结构、高管薪酬、高管团队、研发投入等单方面对企业创新绩效影响的研究,而从混合所有制改革对企业创新投入绩效、创新产出绩效更多层面研究还缺乏,特别针对于唯一从控股母公司和上市公司进行混合所有制改革的国企——云南白药集团公司,其混合所有制改革如何对其创新绩效产生影响,是当前值得深入探讨的问题。本文以云南白药为案例研究对象,探析混合所有制改革对其创新绩效产生的影响及影响路径。首先,梳理国内外混合所有制改革及企业创新绩效等相关的研究成果,以创新理论、委托代理理论、利益相关者理论、资源基础理论为研究基础,诠释了国有企业创新绩效的概念并构建云南白药创新绩效评价指标体系。其次,详细对比分析混改前后云南白药公司创新投入绩效、创新产出绩效和创新环境支持绩效三个维度12个指标变化情况,运用熵值法计算分析云南白药公司混改前后创新绩效总体情况,发现云南白药混改后创新绩效显著提高,其中创新投入和创新产出绩效明显提高,创新环境支持绩效改善不明显。再次,分析了云南白药集团混合所有制改革对创新绩效的传导路径:其一,云南白药在混改过程中通过引入异质性股权和实施整体上市,扩充资金、增加研发费用、实施职业经理人制度、采取员工持股计划和压缩销售费用等措施提高了创新投入绩效;通过引入异质性股权增加非国有资本的话语权,实行市场化决策机制,对企业研发决策和资本逐利性有了极大促进。其二,云南白药在混合所有制改革中引入具有医疗背景的江苏鱼跃,实现产业升级,使创新产出绩效提升;通过采取整体上市的方式,治理结构平台合一,三家企业形成战略联盟并发挥产业协同效应,也对其创新产出绩效起到了提升作用。其三,云南白药通过政府出资,政企合作共建科研平台和享受到创新企业、中药研发的双重税收优惠政策对创新绩效有一定的促进作用,但是效果不明显。最后,结合云南白药公司情况提出加强研发投入、持续推动公司管理创新、加强人才培养与引进和理性评估风险等相关建议。