我国产学研融合进程与产业发展规律和产业结构有关,传统产业由于科技含量不高,总体上产学研融合程度不深。21世纪以来,新一轮科技革命正在酝酿爆发,与产业变革共同重构全球创新版图,重塑全球经济结构,新科技革命在多个领域同时出现变革,并且各领域相互影响,使得创新呈现了新的业态。新科技酝酿了新的产业变革,仅有科技创新,没有将之商品化、产业化的能力无法助推产业发展和经济增长,这需要先进制造与科技创新深度融合,然而新的科技创新大多建立在现有科技基础上,在综合化、多学科知识领域进行突破,投资大、周期长、风险高,这对于资金、人才、管理经验等要素有了更高的要求,传统的产学研合作模式很难满足,需要创新主体及支持机构建立长期稳定的合作关系。产学研深度融合是对产学研各主体合作程度及相互关系的描述。产业界和学术界在内部逻辑、运行机制、利益诉求、文化属性等方面存在较大差异。随着集成创新与创新网络模式的发展,创新不只是发生在大学和研究机构,已经扩展为企业、政府、金融机构、中介机构等多个主体集成创新并形成了一体化的网络结构。第一,本文首先从创新生态系统视角出发,通过对相关研究成果的归纳、梳理,对产学研深度融合内涵进行了定义,在产学研合作创新过程中,以创新链条全过程为基础,创新主体与支持主体之间相互作用形成的互利、共生的创新生态。同时构建了我国产学研深度融合的“中心-外围”分析框架,研究了主体要素、资源要素、环境要素和关系要素等基本结构,以及创新生态系统的演化规律。创新生态系统的演化表现为主导创新种群的优胜劣汰、不断演替,通过聚集与扩散机制的作用,创新种群环境适应力逐渐增强,创新能力和产业竞争力不断增强,从而推动科技创新和产业升级进程不断加快。第二,本文对创新生态系统中各链的融合机制及困境进行了探讨。与自然界中形成的生态系统类似,不同创新种群之间存在基于创新行为的竞争、互利、共生等各种关系,通过集成创新和分工与协作,以供需关系为纽带,基于科学研究、产品研发、产业化等创新链条全流程,创新生态系统存在技术创新链与产业链、金融链、服务链等生态链,各链之间以及与创新环境的交互作用构成了创新生态系统的复杂变化,并提出要在制度创新引领下,充分发挥政府的积极作用和市场自发调节作用,破除创新关卡、促进“四链合一”。第三,论文研究了创新生态系统视角下产学研深度融合的动力机制,其中既有创新环境的诱导作用,也有创新资源流动转化的整合作用,共同形成了促进产学研合作向深度融合的动力因素。此外,还分析了动力机制的演变过程,产学研深度融合过程中存在着形成动力、融合动力和发展动力的不同作用形式,需要破除阻碍动力因素作用发挥的障碍,促进产学研深度融合。第四,论文在分析产学研深度融合模式的基础上进行了案例研究。以硅谷产学研融合自发形成的创新生态为例,硅谷地区以大学衍生企业为基础,政府、风险投资机构、科技服务机构等主体深度参与、加快促进,形成了充满创新创业活力的创新生态。斯坦福大学通过建立工业园区、鼓励教师和学生积极创业、强化教师、学生与企业人员深入交流等多项措施,促进了产学研的深度融合,在这个过程中,以关键种群的不断交替为特征,源创新和流创新的共同作用导致硅谷的创新生态不断演替。第五,在现有分析的基础上,本文基于创新生态系统的视角提出促进产学研深度融合的对策建议。包括营造促进产学研深度融合的创新生态环境,深化产学研深度融合的体制机制改革,完善科技中介服务体系,构建创新导向的金融支持体系,着力提升企业技术创新能力等方面。