扬子鳄(Alligator sinensis)作为我国特有的一种鳄类动物,近一百多年来受到过度捕猎和栖息地减少等因素的影响,至今仍处于极度濒危的状态。为了保护扬子鳄免于灭绝,我国于20世纪70年代末开始建立扬子鳄保护区并开展了人工繁育项目。经过四十年的保护,扬子鳄圈养种群不断壮大,为扬子鳄野生种群的重建和复壮提供了丰富的资源。对于扬子鳄的重引入工程,其成功的关键是要保证圈养个体对野外环境的适应潜力。但是研究发现,长期圈养的动物对野外环境的适应能力降低;并且,过高的饲养密度会对动物的行为、生理和免疫功能等造成不利的影响。所以,开展有关扬子鳄圈养种群生理和免疫等方面的研究十分必要,可为扬子鳄的物种保护和重引入提供更多信息。本研究以浙江省长兴扬子鳄保护区中的扬子鳄七龄鳄群体为研究对象,针对免疫系统中一种重要的组成成分——防御素进行了研究。首先,利用反转录荧光定量PCR技术检测了41个扬子鳄七龄鳄个体血液中9个β防御素基因的表达情况,获得了β防御素基因的血液表达谱;然后,通过分析不同饲养密度和不同性别的群体间防御素基因相对表达量的差异,探究了饲养密度对扬子鳄群体免疫功能的影响;最后,为了探究防御素基因在表观遗传水平上的调控机制,选择了在扬子鳄不同个体间表达差异较大的AsBD8基因进行启动子DNA甲基化水平的分析。利用亚硫酸氢盐修饰后测序法检测了表达量相对较高和较低的两组扬子鳄个体间AsBD8基因启动子区CpG位点的甲基化水平,并进一步分析了其与基因表达差异的相关性。主要研究结果如下:(1)成功筛选出9个β防御素基因的qPCR引物,获得了扬子鳄β防御素基因家族的血液表达谱。(2)扬子鳄群体血液中表达的防御素基因有AsBD5和AsBD8,并且两个基因的表达量之间存在显著的正相关性。(3)在不同饲养密度下,两个扬子鳄群体间的表达水平存在显著的差异。饲养密度较高的扬子鳄群体,整体的防御素表达水平更高,表明饲养密度对扬子鳄圈养种群的免疫状态有一定的影响。(4)AsBD8表达水平具有很大差异的不同扬子鳄个体间,其启动子区域上各CpG位点的甲基化水平没有显著的差异,表明AsBD8表达水平在个体间的差异与表观遗传上基因启动子DNA甲基化的调控无关。本研究为之后有关扬子鳄β防御素基因的功能和表达调控机制等研究提供了基础,并且为扬子鳄的物种保护和种群管理工作提供了新的线索。