配偶选择是影响动物繁殖适合度的重要因素。雌性通过审慎地选择配偶以获得食物、领地等直接收益,或通过子代获取遗传上的间接收益。目前,用于解释配偶选择间接收益的假说主要有好基因、杂合子优势、异型交配与近交避免假说。川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)是我国特有的珍稀濒危动物,生活在以一雄多雌(One-Male Unit,OMU)为基本单元的重层社会结构中。雌性川金丝猴可以突破社会结构的限制,在单元间迁移更换配偶,在单元主雄替换时发挥主导作用,在群内频繁进行单元外交配并生育单元外后代。但雌性川金丝猴评估潜在配偶的标准和进行单元外交配的原因尚不清楚。本研究以MHC(major histocompatibility complex,MHC)II类DPB1和微卫星位点为分子标记,评估了秦岭玉皇庙西梁群川金丝猴的遗传多样性,并分析了该群雌性川金丝猴配偶选择的基因偏好。主要结果如下:1.群体遗传多样性的结果表明,本研究群在微卫星位点的遗传多样性较高(PIC>0.5),个体的杂合度也较高(H_O>0.5);在DPB1位点具有中等遗传多样性(0.250.05),但发现DPB1位点与雌性配偶选择相关(P<0.05)。3.DPB1位点的偏好选择研究中,发现雌性偏好选择具有DPB1~*02和个体杂合度、个体内多样性高的雄性作为社会配偶和遗传配偶,同时避免选择具有DPB1~*04的雄性作为遗传配偶(P<0.05)。在雌性单元外交配偏好研究中,在DPB1位点的遗传参数中没有发现单元外后代的主雄和单元外后代的生父存在显著差异的证据(P>0.05),但发现单元内后代的主雄在DPB1~*02与个体杂合度及个体内多样性中均显著高于单元外后代的主雄(P<0.05)。综上所述,本研究的川金丝猴群体中,发现DPB1位点与雌性配偶选择相关,而未发现微卫星位点与雌性配偶选择相关的证据。雌性个体在选择社会配偶与遗传配偶时,均偏好选择具有好基因和具有杂合子优势的雄性;当雌性个体的单元主雄具有好基因、个体杂合度及个体内多样性高时,雌性个体不易进行单元外交配。研究结果有助于对笼养川金丝猴的保护和管理。