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马铃薯晚疫病是由致病疫霉菌(Phytophthora infestans)引起的一种毁灭性病害,在世界各主要产区均有发生,严重威胁着马铃薯的生产和产业发展,且每年都造成一定的经济损失。影响晚疫病的发生与流行的主要因素之一是马铃薯晚疫病菌群体遗传结构发生变化。本研究通过采用不同品种马铃薯寄主混合种植,田间自然发病后,于晚疫病不同发病时期采集病样,研究病原菌的遗传多样性及生理小种的变化,探索品种多样性对马铃薯晚疫病菌群体的选择压力,为更安全有效地持续控制晚疫病提供理论基础。本研究主要结果如下：1.本研究于2012年采集样本并分离获得1494株。利用8对SSR引物对该群体的基因型进行分析：共鉴定出基因型41种,其中基因型1的菌株有1085株,占总数的72.62%,是主要基因型,具有绝对优势；次要基因型包括基因型7、13、29共289株,占总数18.68%；稀有基因型的菌株有130株,占总数的8.70%。说明该群体的基因型以基因型1为主,占统治地位,其他基因型也占有一定比例。2.对2012年马铃薯晚疫病菌群体的遗传多样性分析得出：Shannon’s多样性信息指数在0.0056-0.4351之间,Nei’遗传多样性指数在0.0013-0.2132之间,表明该马铃薯晚疫病菌群体的遗传多样性较低。不同发病时期分析结果表明,该群体在发病初、中、晚期的遗传多样性指数分别为0.0376、0.0594、0.0572,晚疫病菌群体的遗传结构呈动态变化,其中发病中期的遗传多样性各项指数相对较高。不同种植模式下晚疫病菌群体的分析结果表明：2-4个马铃薯品种混种时,采集获得的晚疫病菌群体的遗传多样性相比单品种种植的高；说明品种多样性对晚疫病菌群体具有稳定化选择作用。3.对2012年和2013年马铃薯晚疫病菌的生理小种研究分析得出：连续2年的晚疫病菌群体均能全部克服11个单抗性基因,以1.2.3.4.5.6.7.8.9.10.11为优势小种也是超级生理小种,其出现的比例在2012年和2013年分别是47.26%、80.48%,说明该群体的致病基因已能使马铃薯全部致病,生理小种以超级生理小种为主,在品种多样性条件下不同发病时期和不同年份生理小种呈动态变化。