土地整治等涉农项目是为改善民生,促进乡村振兴和“三农”工作高质量发展的有效手段,其运作往往离不开科层体制、科层链条的层层传递,同时,通过项目制专业化的运作方式,实现中央和地方的联动,推动国家治理社会事务方式模式的不断创新,提高项目实施和运行的效率。科层制和项目制之间着三种张力——科层的常态性与项目的时段性;科层条线传递与项目统一规划;科层的规则导向与项目的目标导向。因此,本文从科层制与项目制逻辑出发,以项目整合为治理工具,运用案例分析法和实地调研法,研究涉农项目的阶段变化、运行机制,以期为涉农项目运行逻辑提供新的解释框架和研究视角。本文主要研究内容为:（1）提出科层制与项目制双重逻辑分析框架。将科层制逻辑、项目制逻辑放在同一框架中,分析二者如何在耦合的基础上推动涉农项目高效运行。（2）结合国家战略背景及相关政策变化进行分析,对涉农项目运行和管理的变化以及背后的逻辑变迁进行分析,总结各个阶段运行逻辑及困境。（3）基于双重逻辑分析涉农项目运行的机制。从项目生成、项目实施、项目监管三个关键环节切入,探讨各个环节影响涉农项目运行的因素。研究显示:（1）涉农项目运行遵循的是科层制与项目制的双重逻辑。科层制为涉农项目运行提供组织体系、进行监督管理,保障涉农项目的公共性。项目制通过市场化的运作提高涉农项目资金的使用效率,促进社会公平及均衡发展。呈现出“科层为体、项目为用”式的项目运作机制。（2）脱贫攻坚期间涉农项目的整合,需要新的运作模式,产生了新的运行逻辑。以脱贫攻坚期间、以及之前、之后三个阶段来分析,国家战略背景的转变及涉农资金政策变化是项目运行模式发生变迁的关键因素,在不同阶段呈现出不同的运行逻辑。（3）科层制逻辑与项目制逻辑贯穿在涉农项目的生成、实施、监管运行过程中,且形态不断变化。本文对乡村振兴战略背景下,探索涉农项目的发展模式与实践路径具有一定的理论和指引作用。