水稻窄叶突变体nal7-2(t)的遗传分析和基因定位

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水稻是最主要的粮食作物之一,世界上超过50%的人口以稻米为主食。提高水稻产量对保障粮食安全至关重要。理想株型育种是提高单产的重要途径之一,而窄叶性状是水稻理想株型的重要的指标。因此,对水稻窄叶性状进行深入的遗传机理分析,寻找新的等位基因对培育具有理想株型的水稻新品种具有重要的理论意义。本实验在9311辐射诱变的突变体库中发现一个叶片显著变窄的突变体,暂命名为nal7-2(t)。对nal7-2(t)突变体进行了较系统的农艺性状分析,并用nal7-2(t)与9311杂交构建正反交群体进行遗传分析;同时以nal7-2(t)为父本,与9516、桂朝2号和02428为母本杂交的F2群体用于精细定位,并对定位区间内候选基因进行分析。主要结果如下:1.在苗期,nal7-2(t)叶宽与9311无明显差异;从分蘖期开始,nal7-2(t)叶片慢慢窄化;成熟期农艺性状考察发现,与9311相比,nal7-2(t)上三叶叶宽降低,叶长无显著差异,有效分蘖增加,株高、千粒重、结实率、粒长、粒宽、穗长和总粒数极显著降低。对9311和nal7-2(t)的节间配置分析发现,nal7-2(t)的各节间长度的显著降低导致了株高的矮化。2.石蜡切片结果表明,与9311相比,nal7-2(t)大维管束和小维管束的数目极显著的降低,分别为9311的70.0%和48.0%,说明叶片维管束发育的异常导致了nal7-2(t)叶片变窄。3.遗传分析表明,nal 7-2(t)的窄叶表型由一对隐性核基因控制。4.利用nal7-2(t)和9516、桂朝2号、02428杂交得到的F2群体,将基因定位在第7号染色体长臂上116kb的区间内。对区间内候选基因测序发现,编码生长素酰胺合成酶的LOC_Os07g40290基因第2外显子碱基A被替换为C,编码的氨基酸由天冬氨酸变为丙氨酸,将LOC_Os07g40290初步确定为候选基因。5.RT-PCR分析发现,LOC_Os07g40290在根、茎、叶和穗中表达,且在穗中表达最高,在叶鞘中几乎不表达。与9311相比较,该基因在nal7-2(t)的叶片中的表达量极显著降低。6.NAL7-2(t)基因的突变,影响窄叶相关基因和生长素合成、运输相关基因的表达。NAL7-2(t)基因的表达受外源NAA的影响。
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