水痘—带状疱疹病毒临床分离株基因特征分析

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qwert730202
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究合肥地区水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus, VZV)的分子流行病学特征,明确本地区临床分离株的主要基因型及其与国外各地区基因型的差异,并进一步追踪引发感染毒株的来源和特征,了解可能的疫苗反应及病毒的进化状态。方法:从临床采集水痘或带状疱疹患者皮肤水疱液标本61份,分别接种至人胚胎成纤维细胞(HF),进行病毒分离;对分离得到的病毒株应用间接免疫荧光法鉴定后,体外培养病毒并提取DNA。经过PCR扩增VZV开放读码框(ORF)1,6,21,22,38,54,62的部分片段,通过限制性片段长度多态性分析(RFLP)对ORF6,38,54和62的AluI、PstI、BglI、SmaI、NaeI和BssHII酶切位点的突变情况进行分析;对ORF1、21、22和54的PCR产物进行测序,分析其中一些特定SNP位点的突变情况,从而确定其基因型别;PCR扩增VZV糖蛋白gB(ORF31)、gE(ORF68)、gH(ORF37)、gI(ORF67)、gL(ORF60)和早期蛋白IE62(ORF62)全长,对PCR产物测序,分析其中SNP位点的突变情况,并使用MEGA 4.02软件用邻接法(neighbor joining)构建进化树。对筛选到的基因型为疫苗相关的分离株进一步分析ORFs1、31、51和62中的SNP位点以获取病毒学证据,并对患者进行回顾性调查以寻找毒株可能的来源。结果:从临床采集的61份标本中经病毒分离鉴定后得到阳性标本44份,病毒分离阳性率为72.1%。分离株RFLP分析结果显示,44份临床分离株中酶切特征为AluI-PstI+BglI+SmaI-NaeI-BssHII-的有42例(96%),与疫苗亲本病毒(p-Oka株)一致为AluI-PstI-BglI+ SmaI-NaeI-BssHII-有1例(2%),另1例为AluI-PstI- BglI+ SmaI+NaeI+BssHII+,与疫苗株(v-Oka株)一致(2%)。分子病毒学证据和回顾性调查显示由疫苗株VZV引起的水痘,病毒系从其一位接种过疫苗后患了带状疱疹的男童感染而来。三种基因分型方法显示43例毒株为J/J1/C型,1例为J/J2/B型,同时还发现我们以往报道的在ORF1中核苷酸780~781位点之间插入3个核苷酸CGG的现象在新分离的毒株中也存在(18.2%);另外,在所有分离株ORF60 SNP101623~101624之间插入了3个核苷酸ATC,其中还有4例毒株SNP101245发生了A>G的同义突变(9.1%),其中2例毒株ORF1同时也发生了3个核苷酸的插入突变。进化分析提示这些变异使病毒分成4个亚支。结论:本研究显示:一、合肥地区VZV毒株的遗传特征高度保守,J1型占绝对优势,根据有限的变异位点可将44例毒株分成4个亚分支。二、本地区存在疫苗引起水痘的病例,分析ORFs6、62中的限制性片段长度多态性能够区分疫苗株和野毒株,对ORFs1、31、51和62中的单个核苷酸多态性位点进行分析还可以追踪疫苗致病的毒株来源。三、在我国首次发现了罕见的AluI-PstI- BglI+ SmaI-NaeI-BssHII-毒株,该毒株系亚洲除日本以外的首例。研究VZV的基因特征对积累我国水痘-带状疱疹分子流行病学基线数据具有重大意义,同时也有助于监测和阐明VZV的传播机制。
其他文献
近年来,同煤集团以培育和践行社会主义核心价值观为主线,紧扣“建设新同煤、打造新生活”发展战略,以“百里煤海文明大创建”为抓手,努力营造良好社会风尚,先后有4家单位荣获
<正>福泉市根据各级各部门职能,结合工作实际,实行多重责任包保工作机制,助推"国家卫生城市"创建工作开展,形成了纵向到底、横向到边的网格化创卫网络,全社会重视和参与的良
噪音低与无触点运行是直线电机驱动系统主要的两个表现形式,与传统机床中的电机驱动系统相比较,其传递效率较高,且传递过程中误差较小。文章就目前直线电机驱动系统以及应用展开
热带雨林是地球上抵抗力稳定性最高的生态系统,常年气候炎热,雨量充沛,季节差异极不明显,生物群落演替速度极快,是世界上大于一半的动植物物种的栖息地。近年来海南省政府在积极采取多种措施进行海南热带雨林的生态修复,但是海南热带雨林遭受破坏的状况仍然较为严重。海南热带天然林覆盖率降低,琼中、琼西地区破坏热带雨林的现象频频发生。所以,海南省还须更深入探讨此方面内容,健全热带雨林生态修复制度,丰富生态修复手段
本文以生态绿线视角下促进绿色发展的认证制度为研究对象,先从对生态绿线这一新鲜词汇的理论渊源、词源分析、思维方式、功能及内容等角度展开释义与分析,得出生态绿线是一种倡导人们不断向高质量目标攀登的标杆,是生态文明理论在质量领域的特殊表达。文章在明确了生态绿线的释义及功能之后,对生态绿线与高质量的逻辑关系也进行了论述,进一步指出高质量发展的核心是高质量的供给与高质量的需求,这需要一系列高水准的能够促进绿
目前,我国许多油田一处于“三低”状态,开采成本大、效率低、效果不理想。研制和开发小型高效的油气水分离处理装置,在油井现场对高含水原油初步分离,并进行检测和计量等处理
静脉血栓栓塞症(Venous thromboembolism,VTE)的发病率在全世界范围内呈升高趋势,严重影响患者的生活质量。研究显示流变机械吸栓治疗VTE具有快速清除血栓的特点,其中AngioJe
目的评价组合式吸入麻醉诱导装置在小儿无痛换药中的应用;小儿烧伤后的治疗是漫长的医疗过程,反复多次烧伤换药的疼痛给患儿带来生理和心理的创伤,缺少麻醉医生参与的烧伤换
随着人类生存环境的恶化,恶性肿瘤成为世界上致死率最高的疾病之一,肺癌的发病率及致死率居所有恶性肿瘤之首。肺癌可以分为非小细胞肺癌(non small cell lung cancer,NSCLC)
过去的五年内我国经济不断增长,国民收入也水涨船高,居民的闲余资金不断积累。储蓄等传统金融产品已不能满足居民对高收益的期望,而商业银行个人理财产品一贯良好的历史表现,