近年来，高等学校内部管理的“行政化”问题一直是整个社会关注的热点问题。高校内部管理的“行政化”到底是什么？表面上看是高校按照政府的管理模式来管理高校，不按照高校的规律来办高校。然而它的具体表现有哪些了？有必要找出造成高校内部管理“行政化”的深层次原因，有必要对我国高校的内部管理状况进行全面的研究分析。　　本研究从高校内部管理“行政化”的表象入手，对高校管理的相关历史文献进行梳理后，勾画出我国高校内部管理模式的发展脉络及高校内部管理“行政化”的形成过程。在此基础上，结合高校现状将高校内部管理的“行政化”问题细分为:内部资源分配的“官长化”倾向;内部组织机构的“科层官僚化”倾向;管理制度的“刚性化”倾向;教师学生主体作用的“边缘化”倾向。　　本研究借助政治学，经济学，组织社会学，管理学，教育学的理论对上述几种倾向做了较为透彻的分析，找出了造成高校内部管理“行政化”的主要原因。本研究同时认为现代大学是舶来品，对大学的认识是不够全面的，再加上大学进入我国后经过多次的变革，以至于对大学的性质、功用、大学的理念都多少有些误读，这也是造成高校内部管理“行政化”的原因之一。为此，本研究对一系列似是而非的观点进行廓清，主要围绕大学到底是学术组织还是行政机构、“学术自由”与“教授治校”是大学的灵魂吗、学术精英是否应进入学校管理的核心、“管理就是服务”吗、等一系列问题进行了学理上的分析解答，从源头上还大学一个本应具有的真实面目。本研究还对国外高校内部管理的一系列制度和治理结构设计进行了比较分析，认为现代大学制度是一套有效地制度设计，有助于高校“行政化”问题的解决。　　本研究认为高校内部管理制度的建设既要考虑治理结构的本土化——符合中国的基本国情，又要遵循大学组织内在的逻辑和中国大学的历史传统，使组织有自适应能力，这样才能主动适应外部环境的变化。在机制的构建方面，主要是解决学术权力与行政权力的平衡问题，要设计出一套行政权力与学术权力相互协调发展的激励机制和约束机制。本研究从治理的结构和机制入手提出了高校内部管理重心下移，有效防止组织目标偏移，行政权力与学术权力的冲突及融合，大学校长的遴选，构建民主活跃的高校管理文化等方面的建议，并对建议做出了较为详尽的阐释。　　高校内部管理“去行政化”问题实质上还是属于高校治理问题。本研究认为只有真正对高校有了理性上的认识和了解以后，才能找到高校为什么要“去行政化”的系统支撑理论，才有可能将思想认识转化为具体的实际行动，从而推动高校回归理性发展，使高校能按照其自身的规律健康可持续的发展。